143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1751 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  313  7e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1466  protein of unknown function DUF192  80.67 
 
 		 150 aa  259  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.002216  normal  0.978305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  61.54 
 
 		 160 aa  191  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  57.53 
 
 		 201 aa  186  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  50.99 
 
 		 153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  50.99 
 
 		 153 aa  170  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  55.4 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  49.32 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  49.66 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  48.3 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  53.78 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  51.24 
 
 		 171 aa  144  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  46.94 
 
 		 174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  50.85 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  51.24 
 
 		 168 aa  144  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  54.31 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  54.62 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0757  hypothetical protein  56.3 
 
 		 171 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.065716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  47.29 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  56.3 
 
 		 177 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0794  hypothetical protein  56.78 
 
 		 168 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  43.33 
 
 		 155 aa  135  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1915  hypothetical protein  54.62 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2575  hypothetical protein  55.46 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2527  hypothetical protein  54.62 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  54.62 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2445  hypothetical protein  55.46 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000607297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3171  protein of unknown function DUF192  56.78 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436992  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2251  hypothetical protein  54.62 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0546  hypothetical protein  54.62 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  54.62 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2121  hypothetical protein  54.62 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0562  hypothetical protein  56.78 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0354219  hitchhiker  0.000345519 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1106  exported protein  54.62 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0953  hypothetical protein  54.62 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  50 
 
 		 180 aa  130  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  45.45 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  49.12 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  50.41 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  48.67 
 
 		 223 aa  113  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  47.79 
 
 		 217 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  43.61 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  43.55 
 
 		 156 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  39.13 
 
 		 152 aa  88.6  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  35.97 
 
 		 155 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  41.12 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  42.71 
 
 		 155 aa  84.3  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  35.96 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  35.04 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  37.96 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  32.67 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  41.49 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  41.49 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0065  hypothetical protein  37.27 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  40.43 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  38.1 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1454  hypothetical protein  38.94 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  33.55 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  34.27 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  38.54 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  35.58 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  38.54 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2802  protein of unknown function DUF192  39.8 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  35.29 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0746  hypothetical protein  40.62 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.350923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  43.04 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2374  hypothetical protein  32.74 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  35.04 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  35.11 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2531  hypothetical protein  41.77 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  35.34 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  44.74 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  47.62 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  38.71 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  34.04 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  35.92 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  32.14 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  36.47 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  37.07 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  30.07 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  41.89 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4902  protein of unknown function DUF192  42.86 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  34.07 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  35.85 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  37.76 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  30.22 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5719  hypothetical protein  34.69 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  37.93 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  37.93 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  27.97 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0683  hypothetical protein  27.74 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  41.25 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  37.11 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  34.62 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  31.86 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  37.11 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  35.48 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  32.29 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>