132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2374 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2374  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  333  7.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.912503  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3427  hypothetical protein  42.34 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1289  protein of unknown function DUF192  40.57 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.784605  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2299  hypothetical protein  42.11 
 
 		 171 aa  91.3  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.419159  decreased coverage  0.00439974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  36.96 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2294  protein of unknown function DUF192  41.07 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0142567 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0065  hypothetical protein  35.65 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1560  protein of unknown function DUF192  41.23 
 
 		 168 aa  87.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2570  hypothetical protein  36.42 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0323934  decreased coverage  0.00196515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0576  hypothetical protein  35.07 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0575138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2570  hypothetical protein  40.48 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2354  protein of unknown function DUF192  34.56 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2757  protein of unknown function DUF192  34.56 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3659  hypothetical protein  37.72 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470617  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2663  exported protein  39.64 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1928  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2385  hypothetical protein  38.53 
 
 		 223 aa  80.9  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2760  hypothetical protein  36.75 
 
 		 217 aa  80.5  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2135  hypothetical protein  34.82 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2494  putative signal peptide protein  32.62 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0860  hypothetical protein  36.72 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2646  protein of unknown function DUF192  36 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2898  hypothetical protein  37.27 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5859  hypothetical protein  35.96 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799721  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2480  exported protein  35.34 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  37.75 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0757  hypothetical protein  34.56 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.065716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3327  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461601  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1915  hypothetical protein  42.86 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2527  hypothetical protein  42.86 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4888  hypothetical protein  36.28 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.3133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3471  protein of unknown function DUF192  40.94 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  39.02 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1286  protein of unknown function DUF192  26.81 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3407  protein of unknown function DUF192  40.94 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0459142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3253  hypothetical protein  31.91 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0146534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2551  hypothetical protein  42.86 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.449419  hitchhiker  0.0000437317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2944  hypothetical protein  32.5 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0794  hypothetical protein  42.53 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2763  hypothetical protein  36.28 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0408603  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0767  hypothetical protein  35.71 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000413711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0562  hypothetical protein  42.53 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0354219  hitchhiker  0.000345519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3171  protein of unknown function DUF192  42.53 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436992  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2251  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0546  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2121  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1106  exported protein  42.86 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0953  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0957  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.042613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2782  hypothetical protein  32.85 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000264775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2759  hypothetical protein  33.64 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2575  hypothetical protein  41.76 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2445  hypothetical protein  41.76 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000607297 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1009  protein of unknown function DUF192  35.9 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  35.04 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1054  hypothetical protein  34.11 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1022  hypothetical protein  36 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00948106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2347  hypothetical protein  35.66 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  34.07 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1751  hypothetical protein  32.74 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.15136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  38.26 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1466  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.002216  normal  0.978305 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  33.64 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  39.05 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1454  hypothetical protein  31.51 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  38.3 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  38.64 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  31.03 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  38.54 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  33.61 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  28.76 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  33.64 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.455449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3008  hypothetical protein  33.64 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0666137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1405  hypothetical protein  28.97 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.542001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  31.82 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  31.37 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2635  hypothetical protein  31.43 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  31.03 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2939  protein of unknown function DUF192  33.33 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.153806  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  40.86 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  34.65 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  36.78 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  35.05 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  28.68 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  28.68 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0567964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1497  hypothetical protein  31 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.868857 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.904514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  33.66 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0835  hypothetical protein  32.77 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0746  hypothetical protein  32.77 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.350923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  35.58 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0773  protein of unknown function DUF192  31.19 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  39.77 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  26.12 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3165  hypothetical protein  31.19 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.753693  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1924  hypothetical protein  32.73 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02385  hypothetical protein  28.95 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>