More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2222 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2222  transposase  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0428  transposase  55.34 
 
 		 277 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0288  transposase  53.82 
 
 		 277 aa  288  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1229  ISSdy1, transposase OrfB  48.48 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0649083  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1244  ISSdy1, transposase OrfB  48.66 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00850335  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1854  integrase catalytic subunit  51.65 
 
 		 189 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.578694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2557  Integrase catalytic region  34.89 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  35.07 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  35.07 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  35.07 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  33.7 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2546  Integrase catalytic region  33.21 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0771  Integrase catalytic region  33.58 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4217  Integrase catalytic region  33.58 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  34.2 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  34.2 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  35.04 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  34.18 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  33.21 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  35.56 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  35.56 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  30.42 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  32.58 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  32.58 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  31.68 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  31.56 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  34.06 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  31.34 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  32.21 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  32.21 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  31.95 
 
 		 378 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  28.9 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  31.95 
 
 		 378 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  31.95 
 
 		 378 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  31.95 
 
 		 378 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  36.29 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  36.29 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  30.04 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  33.08 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  33.08 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  33.08 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  33.08 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  33.08 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  33.08 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  33.08 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  30.71 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  33.08 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  33.08 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  33.08 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  33.08 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  32.7 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  32.7 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0154  Integrase catalytic region  32.7 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  32.7 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  32.7 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0978  Integrase catalytic region  32.7 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  32.7 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  33.08 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  32.69 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  32.69 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  32.69 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  32.69 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  32.69 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  29.25 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  29.25 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  31.7 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  32.32 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  32.32 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  32.32 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  32.32 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  32.32 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  31.7 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  29.25 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  32.08 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  32.08 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  28.52 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  31.14 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  31.14 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  31.14 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  31.14 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  28.52 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  28.52 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  29.55 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  29.25 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  29.25 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  27.04 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  28.85 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  31.87 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  31.87 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  31.87 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>