More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_27000  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
302 aa  610  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276058  normal  0.910216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  71.53 
 
 
296 aa  417  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1050  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.03 
 
 
312 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466663  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.79 
 
 
305 aa  355  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112199  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3250  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60 
 
 
305 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.670776  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.49 
 
 
291 aa  345  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1345  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.22 
 
 
308 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  hitchhiker  0.000920684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.37 
 
 
308 aa  340  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0444121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5027  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.16 
 
 
298 aa  339  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2788  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  58.19 
 
 
310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419297  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.26 
 
 
298 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3307  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.09 
 
 
300 aa  326  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3198  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.97 
 
 
295 aa  325  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000417891  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3109  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.2 
 
 
309 aa  322  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0991  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.88 
 
 
331 aa  321  8e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1572  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.88 
 
 
315 aa  320  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3032  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.58 
 
 
297 aa  312  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2661  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.51 
 
 
313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.54 
 
 
296 aa  276  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1170  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  50.18 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0239338  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3544  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.9 
 
 
306 aa  232  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.373461 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.51 
 
 
343 aa  226  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0219  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.55 
 
 
310 aa  225  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.69 
 
 
319 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.24 
 
 
300 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.88 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1122  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.51 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.476308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.94 
 
 
312 aa  218  8.999999999999998e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.48 
 
 
300 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3208  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.64 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.58 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.85 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0522  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.65 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.58 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.32 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4039  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.01 
 
 
296 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7060  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.14 
 
 
305 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377124  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.18 
 
 
317 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.79 
 
 
294 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2676  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.81 
 
 
300 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.64 
 
 
298 aa  209  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3734  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.86 
 
 
298 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.130481  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.57 
 
 
296 aa  208  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1600  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.96 
 
 
310 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.143664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1881  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.31 
 
 
310 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2319  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.29 
 
 
287 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.576845  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2124  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.64 
 
 
305 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.432021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4919  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.13 
 
 
306 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.29 
 
 
296 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1723  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.27 
 
 
303 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.42 
 
 
291 aa  206  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0179817  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1450  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.91 
 
 
303 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.26 
 
 
311 aa  205  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.88 
 
 
294 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.91 
 
 
303 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1765  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.86 
 
 
295 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294804  normal  0.0134903 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3955  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.41 
 
 
294 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40 
 
 
297 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0514  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40 
 
 
297 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3612  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40 
 
 
297 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40 
 
 
295 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4054  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40 
 
 
297 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.5 
 
 
295 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0538  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40 
 
 
295 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1639  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.12 
 
 
310 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3169  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.64 
 
 
296 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3774  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40 
 
 
295 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0566  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40 
 
 
295 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40 
 
 
295 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2916  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.67 
 
 
276 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.07 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.52 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.16 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.52 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.67 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.88 
 
 
276 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2028  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.35 
 
 
305 aa  200  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4223  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.86 
 
 
295 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2125  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  39.8 
 
 
320 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2762  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.35 
 
 
298 aa  199  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3409  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.72 
 
 
320 aa  198  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110257  normal  0.0203193 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1732  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.84 
 
 
301 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000245457  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
294 aa  198  7.999999999999999e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0180  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.58 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1700  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.15 
 
 
289 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0336606  normal  0.748539 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2321  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.58 
 
 
288 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2925  methylenetetrahydrofolate reductase  37.29 
 
 
305 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.49 
 
 
275 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0125  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.49 
 
 
298 aa  195  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.77 
 
 
297 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  40.43 
 
 
276 aa  195  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03524  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.68 
 
 
295 aa  195  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.07 
 
 
282 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.96 
 
 
300 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444292  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.43 
 
 
276 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1081  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.36 
 
 
308 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517774  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3163  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.09 
 
 
276 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.43 
 
 
276 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.57 
 
 
281 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.09 
 
 
276 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>