281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04353 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
275 aa  568  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  83.58 
 
 
275 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0614  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  81.68 
 
 
275 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0466  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  82.85 
 
 
275 aa  465  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2840  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.223296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3163  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.4 
 
 
276 aa  343  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3136  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3836  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139843  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1703  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.708829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3377  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.78 
 
 
276 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0256  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.78 
 
 
276 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2896  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.46 
 
 
286 aa  339  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2833  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.78 
 
 
276 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0274  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.78 
 
 
276 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320742  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.78 
 
 
276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.78 
 
 
276 aa  338  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.29 
 
 
277 aa  338  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.41 
 
 
276 aa  338  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.78 
 
 
276 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.83 
 
 
289 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  58.82 
 
 
276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.04 
 
 
276 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.09 
 
 
276 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.72 
 
 
276 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.46 
 
 
281 aa  328  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.83 
 
 
281 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2539  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.56 
 
 
281 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0456939  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.72 
 
 
289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1822  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.33 
 
 
285 aa  325  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00652514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.09 
 
 
281 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2916  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.35 
 
 
276 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.56 
 
 
281 aa  324  9e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0180  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.35 
 
 
276 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.67 
 
 
295 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.25 
 
 
274 aa  323  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.46 
 
 
280 aa  323  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.2 
 
 
282 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.67 
 
 
281 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  57.93 
 
 
276 aa  322  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.3 
 
 
281 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.3 
 
 
281 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3756  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.2 
 
 
276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.46 
 
 
290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2264  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.56 
 
 
289 aa  317  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.19 
 
 
281 aa  315  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0491  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.3 
 
 
276 aa  315  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.24 
 
 
284 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2680  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.47 
 
 
297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.883975  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.44 
 
 
282 aa  308  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.41 
 
 
283 aa  305  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4058  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.61 
 
 
282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.450215  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3288  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  55.19 
 
 
286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16886  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0117  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.51 
 
 
279 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.08621 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.19 
 
 
283 aa  299  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2001  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.56 
 
 
276 aa  298  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.61 
 
 
275 aa  298  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.59 
 
 
277 aa  297  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0468  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  50.92 
 
 
297 aa  294  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301615  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1717  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.34 
 
 
276 aa  294  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.449372  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.4 
 
 
283 aa  292  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0620  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.51 
 
 
279 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0599  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.51 
 
 
279 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4681  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.77 
 
 
274 aa  289  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.72 
 
 
304 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302516  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0036  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  49.82 
 
 
290 aa  275  4e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0967  methylenetetrahydrofolate reductase  47.81 
 
 
281 aa  275  6e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.421092  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2143  methylenetetrahydrofolate reductase  49.45 
 
 
290 aa  275  8e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450301  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1449  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  46.72 
 
 
282 aa  270  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.91 
 
 
272 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.91 
 
 
272 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0914  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.72 
 
 
287 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.99 
 
 
294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.39 
 
 
304 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.03 
 
 
343 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.81 
 
 
299 aa  224  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4323  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.44 
 
 
296 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4033  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.81 
 
 
296 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.07 
 
 
297 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.07 
 
 
296 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2319  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.55 
 
 
287 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.576845  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.7 
 
 
291 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0185  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.71 
 
 
298 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.71 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0125  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.71 
 
 
298 aa  222  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03827  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.44 
 
 
296 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.44 
 
 
296 aa  221  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4481  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.44 
 
 
296 aa  221  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4428  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.44 
 
 
296 aa  221  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4074  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.44 
 
 
296 aa  221  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.44 
 
 
296 aa  221  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.426322 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03776  hypothetical protein  40.44 
 
 
296 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4175  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.44 
 
 
296 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.71 
 
 
296 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5402  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.44 
 
 
296 aa  221  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.60963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.58 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.16 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.84 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>