More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3032 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3032  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
297 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2661  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.5 
 
 
313 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.72 
 
 
296 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1572  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.99 
 
 
315 aa  329  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3250  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.48 
 
 
305 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.670776  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1050  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.65 
 
 
312 aa  319  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5027  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.8 
 
 
298 aa  316  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.16 
 
 
305 aa  315  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112199  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1345  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.94 
 
 
308 aa  315  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  hitchhiker  0.000920684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27000  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.07 
 
 
302 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276058  normal  0.910216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2788  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  56.18 
 
 
310 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419297  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3307  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.24 
 
 
300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.84 
 
 
291 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.23 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0444121  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.33 
 
 
298 aa  301  7.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0991  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.85 
 
 
331 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232217  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3109  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.74 
 
 
309 aa  295  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3198  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.36 
 
 
295 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000417891  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.17 
 
 
296 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1170  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  48.76 
 
 
298 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0239338  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.84 
 
 
312 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0219  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.99 
 
 
310 aa  206  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.07 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.49 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3169  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.79 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.79 
 
 
296 aa  198  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0522  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.38 
 
 
296 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.44 
 
 
297 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0514  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.44 
 
 
297 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3612  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.44 
 
 
297 aa  193  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4054  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.44 
 
 
297 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.44 
 
 
295 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0538  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.44 
 
 
295 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0566  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.44 
 
 
295 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3774  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.44 
 
 
295 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.44 
 
 
295 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.58 
 
 
300 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.79 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4039  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.03 
 
 
296 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.41 
 
 
302 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3996  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40 
 
 
310 aa  189  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1105  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.22 
 
 
293 aa  188  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0497695  normal  0.0196735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.38 
 
 
294 aa  188  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.62 
 
 
291 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0179817  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.6 
 
 
314 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4187  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.41 
 
 
292 aa  186  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.36 
 
 
288 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4033  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.16 
 
 
296 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.32 
 
 
296 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.25 
 
 
297 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.89 
 
 
296 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.426322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.36 
 
 
288 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0967  methylenetetrahydrofolate reductase  36.84 
 
 
281 aa  185  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.421092  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1732  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.01 
 
 
301 aa  185  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000245457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03776  hypothetical protein  37.89 
 
 
296 aa  185  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03827  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.89 
 
 
296 aa  185  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.89 
 
 
296 aa  185  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4428  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.89 
 
 
296 aa  185  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4074  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.89 
 
 
296 aa  185  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4481  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.89 
 
 
296 aa  185  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337619  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002308  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.91 
 
 
300 aa  185  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4175  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.89 
 
 
296 aa  185  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5402  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.89 
 
 
296 aa  185  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.60963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.95 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.97 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.28 
 
 
291 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.28 
 
 
289 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.14 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444292  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0125  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.25 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.95 
 
 
299 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.97 
 
 
304 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2319  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.54 
 
 
287 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.576845  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.19 
 
 
296 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4323  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.19 
 
 
296 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1081  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.14 
 
 
308 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517774  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4440  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.97 
 
 
296 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0185  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.28 
 
 
298 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3208  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.33 
 
 
313 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2321  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.3 
 
 
288 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.56 
 
 
294 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239828  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3805  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.03 
 
 
294 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0123  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.03 
 
 
294 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4093  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.03 
 
 
294 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4511  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.97 
 
 
296 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.23325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1992  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.62 
 
 
291 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000776799  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.19 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3544  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.52 
 
 
306 aa  179  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.373461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.93 
 
 
298 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.97 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1449  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  35.44 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.97 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3734  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.88 
 
 
298 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.130481  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3955  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.4 
 
 
294 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.54 
 
 
281 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00047  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.88 
 
 
300 aa  179  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2539  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.49 
 
 
281 aa  178  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0456939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.19 
 
 
276 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.52 
 
 
317 aa  178  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.19 
 
 
276 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2762  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.68 
 
 
298 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>