296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4437 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
296 aa  617  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4323  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  99.32 
 
 
296 aa  613  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  99.66 
 
 
296 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4440  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  99.32 
 
 
296 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4511  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  99.32 
 
 
296 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.23325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03827  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  95.61 
 
 
296 aa  594  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  95.61 
 
 
296 aa  594  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4175  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  95.61 
 
 
296 aa  594  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03776  hypothetical protein  95.61 
 
 
296 aa  594  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4074  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  95.61 
 
 
296 aa  594  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4481  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  95.61 
 
 
296 aa  594  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4428  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  95.61 
 
 
296 aa  594  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  95.27 
 
 
296 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.426322 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5402  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  95.27 
 
 
296 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.60963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4033  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  93.92 
 
 
296 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  88.47 
 
 
297 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0125  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  87.12 
 
 
298 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3805  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  86.73 
 
 
294 aa  551  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  87.41 
 
 
298 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0185  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  87.07 
 
 
298 aa  551  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  86.44 
 
 
299 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4093  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  86.73 
 
 
294 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0123  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  86.73 
 
 
294 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2762  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  78.23 
 
 
298 aa  487  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00047  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  76.87 
 
 
300 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002308  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  76.87 
 
 
300 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2258  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  76.19 
 
 
304 aa  478  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0561235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  74.58 
 
 
296 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0522  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  74.24 
 
 
296 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4039  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.9 
 
 
296 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3169  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  75.17 
 
 
296 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4054  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.47 
 
 
297 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.47 
 
 
295 aa  461  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0538  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.13 
 
 
295 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.13 
 
 
298 aa  461  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.81 
 
 
297 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0514  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.81 
 
 
297 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3612  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.81 
 
 
297 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0566  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.13 
 
 
295 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.13 
 
 
295 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3774  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.13 
 
 
295 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  72.88 
 
 
296 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.29 
 
 
294 aa  460  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  73.81 
 
 
294 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0162  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  69.02 
 
 
302 aa  449  1e-125  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03524  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  67.12 
 
 
295 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3955  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  65.86 
 
 
294 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.99 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.29 
 
 
314 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0219  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.07 
 
 
310 aa  322  6e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3208  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.92 
 
 
313 aa  319  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.84 
 
 
317 aa  318  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.05 
 
 
319 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1122  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.31 
 
 
309 aa  312  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.476308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.88 
 
 
300 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4919  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.06 
 
 
306 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3544  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.61 
 
 
306 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.373461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0809  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.74 
 
 
288 aa  299  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88075  normal  0.0742908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1881  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.12 
 
 
310 aa  297  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3587 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.69 
 
 
343 aa  297  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.24 
 
 
304 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1600  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.76 
 
 
310 aa  297  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.143664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7060  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.9 
 
 
305 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377124  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1723  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.51 
 
 
303 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2124  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.4 
 
 
305 aa  295  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.432021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.16 
 
 
295 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1765  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.52 
 
 
295 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294804  normal  0.0134903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1639  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.76 
 
 
310 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50 
 
 
302 aa  293  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.85 
 
 
303 aa  292  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1450  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.52 
 
 
303 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4365  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.42 
 
 
306 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0898114  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3734  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.08 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.130481  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4223  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.8 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3409  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.33 
 
 
320 aa  281  9e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110257  normal  0.0203193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2028  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.65 
 
 
305 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.8 
 
 
289 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3163  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.26 
 
 
276 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.8 
 
 
288 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.56 
 
 
300 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444292  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3836  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.89 
 
 
276 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2840  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.89 
 
 
276 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.223296  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.89 
 
 
276 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.89 
 
 
276 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3136  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.89 
 
 
276 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.89 
 
 
276 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1703  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.89 
 
 
276 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.708829  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1700  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.93 
 
 
289 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0336606  normal  0.748539 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0256  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.62 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2833  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.62 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0274  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.62 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2878  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.29 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.856826  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3377  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.99 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.99 
 
 
276 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2321  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.2 
 
 
288 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.57 
 
 
288 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.57 
 
 
288 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.26 
 
 
276 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2916  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.26 
 
 
276 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.26 
 
 
276 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>