More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7060 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7060  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377124  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  81.58 
 
 
343 aa  507  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  80.59 
 
 
304 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1765  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  78.75 
 
 
295 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294804  normal  0.0134903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  79.44 
 
 
295 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3734  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  76.39 
 
 
298 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.130481  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4223  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  78.05 
 
 
295 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  70.98 
 
 
317 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3544  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  68.99 
 
 
306 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.373461 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1122  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  68.77 
 
 
309 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.476308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4919  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  69.75 
 
 
306 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.77 
 
 
303 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1723  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.41 
 
 
303 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1450  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.41 
 
 
303 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4365  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  68.71 
 
 
306 aa  371  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0898114  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.68 
 
 
300 aa  368  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2124  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.21 
 
 
305 aa  358  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.432021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1639  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.55 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0219  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.43 
 
 
310 aa  355  5e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1600  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.48 
 
 
310 aa  353  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.143664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1881  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.83 
 
 
310 aa  353  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2028  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.76 
 
 
305 aa  348  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60 
 
 
314 aa  342  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3409  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.06 
 
 
320 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110257  normal  0.0203193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.01 
 
 
319 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.71 
 
 
302 aa  331  9e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.66 
 
 
312 aa  330  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.16 
 
 
300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444292  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3208  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.79 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2925  methylenetetrahydrofolate reductase  57.3 
 
 
305 aa  318  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2878  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.6 
 
 
313 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.856826  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.76 
 
 
298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0125  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.94 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0185  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.76 
 
 
298 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4323  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.61 
 
 
296 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.25 
 
 
296 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.59 
 
 
299 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2258  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  49.49 
 
 
304 aa  296  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0561235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4093  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.69 
 
 
294 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0123  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.69 
 
 
294 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3805  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.69 
 
 
294 aa  296  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03827  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.33 
 
 
296 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.33 
 
 
296 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.33 
 
 
296 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.426322 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4175  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.33 
 
 
296 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4481  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.33 
 
 
296 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4428  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.33 
 
 
296 aa  296  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03776  hypothetical protein  52.33 
 
 
296 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2115  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.11 
 
 
313 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.907506  normal  0.121247 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4074  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.33 
 
 
296 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5402  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.33 
 
 
296 aa  296  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.60963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.9 
 
 
296 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4440  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.9 
 
 
296 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00047  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.71 
 
 
300 aa  295  9e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4511  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.9 
 
 
296 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.23325 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002308  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.71 
 
 
300 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.13 
 
 
297 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4033  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.61 
 
 
296 aa  292  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.48 
 
 
298 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2762  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.18 
 
 
298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.79 
 
 
294 aa  288  9e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.9 
 
 
296 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4039  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.61 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3169  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  49.15 
 
 
296 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0522  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.25 
 
 
296 aa  285  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.71 
 
 
295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.53 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0514  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.53 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3612  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.53 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0538  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.36 
 
 
295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4054  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.18 
 
 
297 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03524  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.44 
 
 
295 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3774  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.36 
 
 
295 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0566  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.36 
 
 
295 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.36 
 
 
295 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0809  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.27 
 
 
288 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88075  normal  0.0742908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  49.82 
 
 
296 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3955  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  49.46 
 
 
294 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  49.29 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0162  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.31 
 
 
302 aa  271  9e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.79 
 
 
288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2319  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.26 
 
 
287 aa  248  9e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.576845  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2321  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.64 
 
 
288 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.09 
 
 
300 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1700  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.52 
 
 
289 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0336606  normal  0.748539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.64 
 
 
288 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.64 
 
 
288 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.53 
 
 
300 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.53 
 
 
276 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.43 
 
 
300 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.66 
 
 
294 aa  229  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.39 
 
 
291 aa  229  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0179817  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2080  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.95 
 
 
289 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.71 
 
 
289 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3163  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.09 
 
 
276 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2833  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.81 
 
 
276 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0274  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.81 
 
 
276 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320742  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3377  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.61 
 
 
276 aa  225  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.32 
 
 
298 aa  225  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0256  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.81 
 
 
276 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>