More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2916 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2916  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0180  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  93.48 
 
 
276 aa  544  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3756  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  91.3 
 
 
276 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2833  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  90.94 
 
 
276 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0274  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  90.94 
 
 
276 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1703  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  89.86 
 
 
276 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.708829  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2840  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  89.86 
 
 
276 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.223296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  89.86 
 
 
276 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3136  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  89.86 
 
 
276 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3163  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  89.86 
 
 
276 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  89.86 
 
 
276 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3836  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  89.86 
 
 
276 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0256  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  90.58 
 
 
276 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  89.86 
 
 
276 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3377  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  90.58 
 
 
276 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  88.77 
 
 
276 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  88.77 
 
 
276 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  89.86 
 
 
276 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  80.6 
 
 
276 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  78.81 
 
 
276 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  77.54 
 
 
276 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  76.45 
 
 
276 aa  454  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  76.81 
 
 
276 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  67.64 
 
 
274 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  68.48 
 
 
276 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2539  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  65.68 
 
 
281 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0456939  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.36 
 
 
289 aa  381  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2896  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  67.4 
 
 
286 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.49 
 
 
277 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.34 
 
 
283 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.89 
 
 
289 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.73 
 
 
283 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.48 
 
 
280 aa  362  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0117  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.64 
 
 
279 aa  362  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.08621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0599  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.47 
 
 
279 aa  361  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0620  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.47 
 
 
279 aa  361  9e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2264  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.88 
 
 
289 aa  360  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.14 
 
 
277 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0491  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.77 
 
 
276 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4058  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.9 
 
 
282 aa  358  5e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.450215  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.62 
 
 
275 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2001  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.13 
 
 
276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1717  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.5 
 
 
276 aa  354  7.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.449372  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4681  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.76 
 
 
274 aa  350  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.81 
 
 
282 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.47 
 
 
282 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.59 
 
 
281 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.1 
 
 
290 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.41 
 
 
281 aa  345  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.85 
 
 
281 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.22 
 
 
281 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.85 
 
 
281 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.48 
 
 
295 aa  338  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2680  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.06 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.883975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.15 
 
 
281 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.04 
 
 
281 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.41 
 
 
281 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.83 
 
 
284 aa  328  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0614  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.67 
 
 
275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.68 
 
 
275 aa  325  5e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.24 
 
 
283 aa  325  6e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.35 
 
 
275 aa  325  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1822  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.72 
 
 
285 aa  321  6e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00652514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3288  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  54.21 
 
 
286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16886  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.68 
 
 
304 aa  319  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302516  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0466  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.95 
 
 
275 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0468  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  53.14 
 
 
297 aa  305  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301615  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0036  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.47 
 
 
290 aa  299  3e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2143  methylenetetrahydrofolate reductase  51.1 
 
 
290 aa  299  4e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450301  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0967  methylenetetrahydrofolate reductase  51.79 
 
 
281 aa  293  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.421092  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1449  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  51.43 
 
 
282 aa  292  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.37 
 
 
272 aa  277  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.37 
 
 
272 aa  277  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0914  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.57 
 
 
287 aa  267  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.45 
 
 
297 aa  251  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.99 
 
 
294 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.81 
 
 
299 aa  249  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4033  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.18 
 
 
296 aa  248  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0125  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.45 
 
 
298 aa  248  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03827  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.91 
 
 
296 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.91 
 
 
296 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5402  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.91 
 
 
296 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.60963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4481  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.91 
 
 
296 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337619  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4175  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.91 
 
 
296 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03776  hypothetical protein  46.91 
 
 
296 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4074  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.91 
 
 
296 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4428  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.91 
 
 
296 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.91 
 
 
296 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.426322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4323  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.99 
 
 
296 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.62 
 
 
296 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0185  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.35 
 
 
298 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.55 
 
 
300 aa  241  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.72 
 
 
298 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4440  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.29 
 
 
296 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.26 
 
 
296 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4511  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.29 
 
 
296 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.23325 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3805  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.72 
 
 
294 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0123  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.72 
 
 
294 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4093  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.72 
 
 
294 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45 
 
 
317 aa  238  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>