283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0406 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
275 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0466  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  99.27 
 
 
275 aa  569  1e-161  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  83.58 
 
 
275 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0614  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  79.49 
 
 
275 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.89 
 
 
289 aa  344  7e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2896  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.35 
 
 
286 aa  342  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.82 
 
 
276 aa  341  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3377  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.72 
 
 
276 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0256  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.09 
 
 
276 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2833  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.09 
 
 
276 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0274  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.09 
 
 
276 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.93 
 
 
277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3163  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.61 
 
 
276 aa  335  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  58.15 
 
 
276 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2840  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.24 
 
 
276 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.223296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.24 
 
 
276 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3136  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.24 
 
 
276 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.24 
 
 
276 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3836  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.24 
 
 
276 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139843  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.24 
 
 
276 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1703  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.24 
 
 
276 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.708829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.56 
 
 
281 aa  334  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.67 
 
 
289 aa  333  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.99 
 
 
276 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.99 
 
 
276 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.2 
 
 
281 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.2 
 
 
281 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.62 
 
 
276 aa  331  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.52 
 
 
281 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.15 
 
 
295 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.15 
 
 
281 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.3 
 
 
281 aa  330  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.93 
 
 
282 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.04 
 
 
276 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.15 
 
 
281 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.67 
 
 
276 aa  329  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2539  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.67 
 
 
281 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0456939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.2 
 
 
290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  58.3 
 
 
276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2916  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.68 
 
 
276 aa  325  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.04 
 
 
281 aa  325  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1822  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.57 
 
 
285 aa  323  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00652514  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.13 
 
 
276 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0180  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.51 
 
 
276 aa  322  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.98 
 
 
274 aa  322  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.83 
 
 
280 aa  321  8e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0491  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.88 
 
 
276 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3756  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.15 
 
 
276 aa  318  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.44 
 
 
284 aa  318  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2264  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.13 
 
 
289 aa  316  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.58 
 
 
283 aa  315  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.56 
 
 
282 aa  314  9e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4058  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.21 
 
 
282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.450215  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0117  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.11 
 
 
279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.08621 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2001  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.51 
 
 
276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.58 
 
 
275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2680  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.48 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.883975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4681  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.48 
 
 
274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.55 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.38 
 
 
283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.75 
 
 
283 aa  301  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1717  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.37 
 
 
276 aa  300  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.449372  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3288  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  53.11 
 
 
286 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16886  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0599  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.31 
 
 
279 aa  298  8e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0620  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.31 
 
 
279 aa  298  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0468  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  48.34 
 
 
297 aa  287  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301615  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0967  methylenetetrahydrofolate reductase  47.62 
 
 
281 aa  278  7e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.421092  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.9 
 
 
304 aa  278  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302516  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1449  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  46.52 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2143  methylenetetrahydrofolate reductase  47.99 
 
 
290 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0036  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.99 
 
 
290 aa  271  6e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.23 
 
 
272 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.23 
 
 
272 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0914  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.15 
 
 
287 aa  259  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.76 
 
 
294 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2319  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.82 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.576845  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.34 
 
 
300 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
304 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.03 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.13 
 
 
343 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.85 
 
 
317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.07 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.7 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.73 
 
 
298 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0185  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.73 
 
 
298 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.73 
 
 
314 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.15 
 
 
312 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.73 
 
 
299 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0125  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37 
 
 
298 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4033  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.73 
 
 
296 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37 
 
 
296 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2925  methylenetetrahydrofolate reductase  39.49 
 
 
305 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4323  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37 
 
 
296 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.28 
 
 
300 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444292  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37 
 
 
297 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.63 
 
 
296 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.6 
 
 
298 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.62 
 
 
295 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4187  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.61 
 
 
292 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.93 
 
 
302 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>