More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0488 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
281 aa  587  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  97.15 
 
 
281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  97.15 
 
 
295 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  97.15 
 
 
281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  86.83 
 
 
281 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  86.48 
 
 
281 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  85.77 
 
 
281 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  86.48 
 
 
281 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  84.04 
 
 
282 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  83.63 
 
 
281 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  82.98 
 
 
290 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  71.74 
 
 
289 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2896  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.3 
 
 
286 aa  401  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  68.63 
 
 
282 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  64.49 
 
 
276 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.45 
 
 
276 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.09 
 
 
276 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.09 
 
 
276 aa  364  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2264  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.82 
 
 
289 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  62.09 
 
 
276 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2539  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.54 
 
 
281 aa  362  6e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0456939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.59 
 
 
276 aa  359  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.55 
 
 
289 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3377  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.22 
 
 
276 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.48 
 
 
284 aa  354  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.4 
 
 
276 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2680  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.42 
 
 
297 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.883975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.22 
 
 
274 aa  350  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0256  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2833  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0274  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.13 
 
 
277 aa  349  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.66 
 
 
276 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.66 
 
 
276 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3163  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.13 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.24 
 
 
275 aa  348  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0599  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.24 
 
 
279 aa  348  8e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0620  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.24 
 
 
279 aa  347  9e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.4 
 
 
276 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3136  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.4 
 
 
276 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2840  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.4 
 
 
276 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.223296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.4 
 
 
276 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3836  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.4 
 
 
276 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139843  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1703  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.4 
 
 
276 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.708829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.4 
 
 
276 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2916  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.59 
 
 
276 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1822  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.57 
 
 
285 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00652514  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0180  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.85 
 
 
283 aa  342  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.21 
 
 
280 aa  341  7e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3756  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.66 
 
 
276 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4681  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.85 
 
 
274 aa  338  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0491  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.48 
 
 
276 aa  337  9e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2001  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.91 
 
 
276 aa  335  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4058  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.29 
 
 
282 aa  334  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.450215  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.41 
 
 
277 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0117  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
279 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.08621 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.52 
 
 
275 aa  331  7.000000000000001e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1717  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.91 
 
 
276 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.449372  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0614  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.09 
 
 
275 aa  330  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.71 
 
 
304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302516  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.14 
 
 
283 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.19 
 
 
283 aa  326  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.67 
 
 
275 aa  323  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1449  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  55.23 
 
 
282 aa  322  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0468  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  55.96 
 
 
297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301615  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0967  methylenetetrahydrofolate reductase  54.87 
 
 
281 aa  318  5e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.421092  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0466  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.15 
 
 
275 aa  316  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3288  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  54.38 
 
 
286 aa  314  9e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16886  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0914  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.68 
 
 
287 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0036  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.03 
 
 
290 aa  306  3e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2143  methylenetetrahydrofolate reductase  51.66 
 
 
290 aa  305  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.71 
 
 
272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.71 
 
 
272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.74 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.09 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.1 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1572  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.62 
 
 
315 aa  235  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.35 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4033  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.59 
 
 
296 aa  231  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.03 
 
 
298 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.29 
 
 
300 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.93 
 
 
300 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.96 
 
 
294 aa  228  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44 
 
 
314 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.22 
 
 
298 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0125  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.48 
 
 
298 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.09 
 
 
291 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3169  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.59 
 
 
296 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03827  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.48 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.48 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4074  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.48 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03776  hypothetical protein  41.48 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4175  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.48 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4428  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.48 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4481  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.48 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.96 
 
 
296 aa  225  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5402  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.48 
 
 
296 aa  225  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.60963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4323  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.48 
 
 
296 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.48 
 
 
299 aa  225  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>