294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0396 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
282 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2896  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  69.26 
 
 
286 aa  391  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  69.37 
 
 
295 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  70.11 
 
 
282 aa  387  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  70.11 
 
 
290 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.04 
 
 
289 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  68.52 
 
 
281 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  68.63 
 
 
281 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  67.9 
 
 
281 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  68.63 
 
 
281 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  68.27 
 
 
281 aa  381  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  67.53 
 
 
281 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  67.16 
 
 
281 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  68.52 
 
 
281 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2264  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.39 
 
 
289 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.8 
 
 
274 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.57 
 
 
276 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  66.04 
 
 
276 aa  364  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.08 
 
 
276 aa  359  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.34 
 
 
276 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.95 
 
 
276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.66 
 
 
276 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.66 
 
 
276 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2833  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  351  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0274  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  351  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320742  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0256  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.03 
 
 
276 aa  351  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.45 
 
 
289 aa  350  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.71 
 
 
277 aa  350  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  62.31 
 
 
276 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2916  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.81 
 
 
276 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3163  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.44 
 
 
276 aa  349  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3377  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.66 
 
 
276 aa  348  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2840  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.07 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.223296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.07 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.07 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3836  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.07 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3136  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.07 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.07 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1703  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.07 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.708829  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2539  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.19 
 
 
281 aa  346  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0456939  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0180  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.07 
 
 
276 aa  344  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3756  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.07 
 
 
276 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2680  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.24 
 
 
297 aa  338  7e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.883975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.11 
 
 
280 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.03 
 
 
284 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.57 
 
 
283 aa  332  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2001  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.82 
 
 
276 aa  332  4e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4681  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.52 
 
 
274 aa  330  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1717  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.89 
 
 
276 aa  330  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.449372  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4058  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.63 
 
 
282 aa  329  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.450215  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0491  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.99 
 
 
276 aa  327  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.43 
 
 
304 aa  328  9e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302516  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0599  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.85 
 
 
279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0620  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.85 
 
 
279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.35 
 
 
277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0614  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.93 
 
 
275 aa  325  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.11 
 
 
283 aa  325  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0117  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.93 
 
 
279 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.08621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.62 
 
 
275 aa  323  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3288  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  57.72 
 
 
286 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16886  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1822  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.8 
 
 
285 aa  314  9e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00652514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0468  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  53.9 
 
 
297 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301615  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1449  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  55.15 
 
 
282 aa  313  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.56 
 
 
275 aa  314  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.18 
 
 
283 aa  308  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.44 
 
 
275 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0967  methylenetetrahydrofolate reductase  54.04 
 
 
281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.421092  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0036  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.99 
 
 
290 aa  305  7e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2143  methylenetetrahydrofolate reductase  51.62 
 
 
290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0466  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.56 
 
 
275 aa  301  7.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0914  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.21 
 
 
287 aa  291  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.33 
 
 
272 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.33 
 
 
272 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.08 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.26 
 
 
291 aa  231  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.36 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.15 
 
 
314 aa  218  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.64 
 
 
300 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.91 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.91 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.84 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.6 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.07 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.71 
 
 
291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0179817  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1081  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.24 
 
 
308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517774  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.84 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0185  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.46 
 
 
298 aa  211  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.57 
 
 
319 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.73 
 
 
298 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3955  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.22 
 
 
294 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4033  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.46 
 
 
296 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0125  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.46 
 
 
298 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.01 
 
 
296 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5027  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.85 
 
 
298 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.75 
 
 
312 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1345  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.35 
 
 
308 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  hitchhiker  0.000920684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4323  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.08 
 
 
296 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.3 
 
 
317 aa  208  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.69 
 
 
296 aa  208  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.426322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>