292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2001 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2001  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
276 aa  573  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1717  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  94.57 
 
 
276 aa  546  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.449372  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  65.44 
 
 
283 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.94 
 
 
276 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.47 
 
 
274 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3163  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.14 
 
 
276 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.77 
 
 
276 aa  367  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  64.47 
 
 
276 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.41 
 
 
276 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3836  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.41 
 
 
276 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2840  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.41 
 
 
276 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.223296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.41 
 
 
276 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3377  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.87 
 
 
276 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3136  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.41 
 
 
276 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0180  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.77 
 
 
276 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.5 
 
 
276 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2833  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.5 
 
 
276 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0274  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.5 
 
 
276 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320742  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0256  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.5 
 
 
276 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0491  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.97 
 
 
276 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.41 
 
 
276 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1703  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.41 
 
 
276 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.708829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.41 
 
 
276 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.41 
 
 
276 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.6 
 
 
283 aa  362  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.87 
 
 
275 aa  362  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3756  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.87 
 
 
276 aa  360  9e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.64 
 
 
276 aa  359  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.27 
 
 
276 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2916  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.13 
 
 
276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.68 
 
 
277 aa  355  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.76 
 
 
277 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0117  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.95 
 
 
279 aa  354  8.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.08621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.37 
 
 
280 aa  353  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  60.66 
 
 
276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2896  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.14 
 
 
286 aa  351  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0599  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.66 
 
 
279 aa  351  7e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0620  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.66 
 
 
279 aa  351  7e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.24 
 
 
289 aa  351  8.999999999999999e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2539  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.29 
 
 
281 aa  350  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0456939  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2264  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.71 
 
 
289 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4681  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.66 
 
 
274 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4058  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.85 
 
 
282 aa  344  8e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.450215  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2680  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.51 
 
 
297 aa  341  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.883975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.93 
 
 
282 aa  337  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.76 
 
 
289 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.91 
 
 
281 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.64 
 
 
281 aa  334  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.82 
 
 
282 aa  332  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.91 
 
 
281 aa  332  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.55 
 
 
281 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.7 
 
 
290 aa  331  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.18 
 
 
295 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.25 
 
 
281 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.25 
 
 
281 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.18 
 
 
281 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.18 
 
 
281 aa  328  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.31 
 
 
283 aa  318  5e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.2 
 
 
284 aa  313  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1822  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  54.41 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00652514  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.51 
 
 
275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0614  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.3 
 
 
275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.56 
 
 
275 aa  298  6e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0468  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  51.84 
 
 
297 aa  296  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301615  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0036  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  51.62 
 
 
290 aa  295  5e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2143  methylenetetrahydrofolate reductase  51.26 
 
 
290 aa  294  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0466  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.48 
 
 
275 aa  292  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.52 
 
 
304 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302516  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3288  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  52.03 
 
 
286 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16886  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1449  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  50.19 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0967  methylenetetrahydrofolate reductase  50.57 
 
 
281 aa  280  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.421092  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0914  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.48 
 
 
287 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48 
 
 
272 aa  251  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48 
 
 
272 aa  251  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.22 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.22 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.45 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.24 
 
 
291 aa  208  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.55 
 
 
317 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5027  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.01 
 
 
298 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0991  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.34 
 
 
331 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232217  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.45 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.64 
 
 
319 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.22 
 
 
300 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.86 
 
 
300 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.19 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3996  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.14 
 
 
310 aa  198  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4323  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.19 
 
 
296 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4033  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.83 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.83 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.14 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.83 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3307  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.07 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.29 
 
 
298 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.46 
 
 
296 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0522  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.93 
 
 
296 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4440  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.46 
 
 
296 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1050  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.29 
 
 
312 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466663  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.29 
 
 
302 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>