More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3109 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3109  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
309 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1050  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  75.42 
 
 
312 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1345  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  70.53 
 
 
308 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  hitchhiker  0.000920684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2788  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  69.01 
 
 
310 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419297  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  69.47 
 
 
308 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0444121  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3250  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.55 
 
 
305 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.670776  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  67.01 
 
 
305 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112199  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1572  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.65 
 
 
315 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3307  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.65 
 
 
300 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5027  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  63.54 
 
 
298 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.27 
 
 
291 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0991  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.62 
 
 
331 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232217  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.97 
 
 
298 aa  348  9e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.1 
 
 
296 aa  344  8e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27000  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.2 
 
 
302 aa  322  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276058  normal  0.910216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3198  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.88 
 
 
295 aa  295  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000417891  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3032  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.74 
 
 
297 aa  289  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2661  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.02 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  49.13 
 
 
296 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1081  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.42 
 
 
308 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517774  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.12 
 
 
300 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.75 
 
 
300 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.12 
 
 
300 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1732  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.64 
 
 
301 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000245457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1170  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  43.84 
 
 
298 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0239338  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.86 
 
 
294 aa  211  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.55 
 
 
319 aa  211  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2676  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.3 
 
 
300 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.08 
 
 
311 aa  209  5e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.07 
 
 
291 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.86 
 
 
343 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.16 
 
 
290 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.75 
 
 
317 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.66 
 
 
296 aa  201  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.6 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.77 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.43 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.95 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2321  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.33 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.48 
 
 
304 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2896  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.86 
 
 
286 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.22 
 
 
300 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.39 
 
 
312 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3169  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.07 
 
 
296 aa  198  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0219  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.29 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3734  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.73 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.130481  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.33 
 
 
288 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.37 
 
 
281 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1765  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.73 
 
 
295 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294804  normal  0.0134903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.49 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.33 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.27 
 
 
291 aa  195  7e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0179817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.94 
 
 
281 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4039  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.19 
 
 
296 aa  195  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.81 
 
 
295 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0522  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.19 
 
 
296 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.73 
 
 
295 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4054  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.19 
 
 
297 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7060  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.48 
 
 
305 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377124  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.83 
 
 
298 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.49 
 
 
276 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3544  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.93 
 
 
306 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.373461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0099  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.03 
 
 
291 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.47967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.19 
 
 
297 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0514  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.19 
 
 
297 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.43 
 
 
294 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3612  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.19 
 
 
297 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  39.64 
 
 
276 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1498  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.57 
 
 
296 aa  193  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00302896  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.55 
 
 
289 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2125  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  37.54 
 
 
320 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1122  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.84 
 
 
309 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.476308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.56 
 
 
281 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.08 
 
 
281 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0967  methylenetetrahydrofolate reductase  37.28 
 
 
281 aa  192  7e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.421092  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.83 
 
 
295 aa  192  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4223  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.73 
 
 
295 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0614  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.04 
 
 
275 aa  192  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3774  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.83 
 
 
295 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0566  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.83 
 
 
295 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.83 
 
 
295 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.49 
 
 
274 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0538  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.83 
 
 
295 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.91 
 
 
284 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.52 
 
 
281 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4919  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.29 
 
 
306 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.02 
 
 
304 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.44 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1647  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.68 
 
 
289 aa  189  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.150812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.52 
 
 
281 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.1 
 
 
296 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.36 
 
 
277 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  37.18 
 
 
276 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.55 
 
 
276 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.6 
 
 
272 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.6 
 
 
272 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4187  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.41 
 
 
292 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.18 
 
 
276 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.62 
 
 
282 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1449  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  35.84 
 
 
282 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>