284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1170 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1170  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  100 
 
 
298 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0239338  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.69 
 
 
296 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27000  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  50.18 
 
 
302 aa  259  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276058  normal  0.910216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3250  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.91 
 
 
305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.670776  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  49.04 
 
 
298 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1572  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.87 
 
 
315 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.42 
 
 
308 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0444121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.26 
 
 
291 aa  235  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3032  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.76 
 
 
297 aa  235  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5027  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.76 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1345  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.97 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  hitchhiker  0.000920684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3307  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.87 
 
 
300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.01 
 
 
305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112199  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2788  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  44.6 
 
 
310 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419297  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0991  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.93 
 
 
331 aa  229  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232217  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1050  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.98 
 
 
312 aa  228  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466663  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3109  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.84 
 
 
309 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2661  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.2 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3198  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.36 
 
 
295 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000417891  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.43 
 
 
296 aa  202  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2525  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.79 
 
 
316 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000354745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4919  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.87 
 
 
306 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.77 
 
 
317 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.18 
 
 
296 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3544  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.13 
 
 
306 aa  168  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.373461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7060  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.09 
 
 
305 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377124  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.81 
 
 
300 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.46 
 
 
300 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1105  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.83 
 
 
293 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0497695  normal  0.0196735 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1992  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.73 
 
 
291 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000776799  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.46 
 
 
300 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2008  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  39.31 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0190876  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.88 
 
 
304 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.07 
 
 
314 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.55 
 
 
300 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3955  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.59 
 
 
294 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1881  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.86 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.68 
 
 
319 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.55 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239828  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1600  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.86 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.143664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4039  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
296 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3034  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.99 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.71 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
296 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3734  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.64 
 
 
298 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.130481  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1122  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.13 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.476308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.01 
 
 
312 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0522  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
296 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2762  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.04 
 
 
298 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3409  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.28 
 
 
320 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110257  normal  0.0203193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2028  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.49 
 
 
305 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.73 
 
 
294 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4033  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.25 
 
 
296 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.231217 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.36 
 
 
289 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.14 
 
 
298 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.53 
 
 
296 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.426322 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1723  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.29 
 
 
303 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03827  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.53 
 
 
296 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.53 
 
 
296 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4074  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.53 
 
 
296 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0185  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.14 
 
 
298 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03776  hypothetical protein  34.53 
 
 
296 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5402  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.53 
 
 
296 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.60963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4481  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.53 
 
 
296 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4428  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.53 
 
 
296 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4175  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.53 
 
 
296 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
295 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0538  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
295 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03524  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.21 
 
 
295 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
297 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0514  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
297 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3612  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
297 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2676  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.52 
 
 
300 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35 
 
 
276 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2124  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.49 
 
 
305 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.432021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.71 
 
 
299 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4054  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
297 aa  158  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4323  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.89 
 
 
296 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.53 
 
 
296 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0566  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
295 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1450  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.59 
 
 
303 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
295 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3774  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.45 
 
 
295 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4440  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.53 
 
 
296 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4511  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.53 
 
 
296 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.23325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.53 
 
 
296 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.59 
 
 
303 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35 
 
 
276 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1639  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.77 
 
 
310 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.7 
 
 
281 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3805  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.25 
 
 
294 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0125  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  33.45 
 
 
298 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0123  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.25 
 
 
294 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4093  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.25 
 
 
294 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.99 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0162  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.42 
 
 
302 aa  155  7e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4223  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.66 
 
 
295 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3169  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.73 
 
 
296 aa  155  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3208  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.27 
 
 
313 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>