More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1401 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
296 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27000  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  71.53 
 
 
302 aa  417  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276058  normal  0.910216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1050  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.97 
 
 
312 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2788  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  60.82 
 
 
310 aa  364  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419297  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3250  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.93 
 
 
305 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.670776  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1572  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  62.37 
 
 
315 aa  355  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.4 
 
 
305 aa  355  5.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112199  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1345  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.79 
 
 
308 aa  348  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  hitchhiker  0.000920684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3198  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.62 
 
 
295 aa  345  6e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000417891  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3109  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.1 
 
 
309 aa  344  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.84 
 
 
291 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5027  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.22 
 
 
298 aa  342  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.3 
 
 
308 aa  339  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0444121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2661  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  56.95 
 
 
313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.22 
 
 
298 aa  335  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3307  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  57.04 
 
 
300 aa  328  8e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3032  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  59.72 
 
 
297 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0991  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.56 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232217  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.26 
 
 
296 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1170  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  52.69 
 
 
298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0239338  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1765  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.75 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294804  normal  0.0134903 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0219  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.66 
 
 
310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4054  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.3 
 
 
297 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3169  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.65 
 
 
296 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
295 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
297 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0514  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
297 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3612  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
297 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0538  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
295 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.73 
 
 
300 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.73 
 
 
300 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3774  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
295 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.86 
 
 
319 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
295 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.22 
 
 
298 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.07 
 
 
295 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0566  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
295 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.85 
 
 
296 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4919  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.61 
 
 
306 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.14 
 
 
300 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7060  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.64 
 
 
305 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377124  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
317 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4039  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.85 
 
 
296 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.49 
 
 
304 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.58 
 
 
312 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.13 
 
 
294 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.81 
 
 
291 aa  201  8e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0179817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.44 
 
 
343 aa  202  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.99 
 
 
294 aa  201  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.25 
 
 
291 aa  201  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4223  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.58 
 
 
295 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1122  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.93 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.476308 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.49 
 
 
296 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0522  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.49 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3544  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.86 
 
 
306 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.373461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.22 
 
 
300 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3734  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.04 
 
 
298 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.130481  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.55 
 
 
294 aa  199  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2676  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.65 
 
 
300 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.94 
 
 
302 aa  199  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.36 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.06 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.13 
 
 
272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.13 
 
 
272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0380  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.29 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.8 
 
 
298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.31 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03827  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.63 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.63 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4481  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.63 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.337619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.71 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4074  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.63 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4784  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.54 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000375918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4175  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.63 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03776  hypothetical protein  38.63 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5402  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.63 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.60963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4428  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.63 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.63 
 
 
296 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.426322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0125  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.54 
 
 
298 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.93 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4437  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.91 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0185  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.07 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.29 
 
 
281 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3996  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.19 
 
 
310 aa  195  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.36 
 
 
282 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.91 
 
 
296 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1732  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.25 
 
 
301 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000245457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4511  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.68 
 
 
296 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.23325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.24 
 
 
314 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0162  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.71 
 
 
302 aa  195  1e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.93 
 
 
281 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4440  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.68 
 
 
296 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.21 
 
 
281 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.93 
 
 
281 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4323  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.91 
 
 
296 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3805  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.46 
 
 
294 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3208  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.99 
 
 
313 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4093  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.46 
 
 
294 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0123  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.46 
 
 
294 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.57 
 
 
289 aa  192  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>