More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0637 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0637  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
384 aa  774    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00837548  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0846  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  65.09 
 
 
384 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.124492  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1168  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  64.77 
 
 
433 aa  502  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0764  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  64.77 
 
 
433 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00454819  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0526  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  63.71 
 
 
429 aa  501  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1043  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  64.25 
 
 
433 aa  500  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0366555  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1462  putative alkyl-dihydroxyacetone phosphate synthase  62.95 
 
 
433 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0320  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  62.83 
 
 
385 aa  490  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1459  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  59.84 
 
 
380 aa  484  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3932  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.78 
 
 
451 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215439  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4272  two-component response regulator  42.67 
 
 
470 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.78 
 
 
451 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190196  normal  0.699272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1534  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.38 
 
 
463 aa  322  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4371  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.05 
 
 
451 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50180  two-component response regulator  42.15 
 
 
473 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  hitchhiker  0.00555849 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.3 
 
 
463 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2563  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.21 
 
 
480 aa  315  6e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2827  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.05 
 
 
470 aa  316  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1719  flagellar regulatory protein C  43.31 
 
 
479 aa  315  8e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0473988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3696  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.98 
 
 
458 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12736  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3459  helix-turn-helix, Fis-type  42.49 
 
 
471 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0916  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.09 
 
 
480 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1405  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.78 
 
 
478 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000117702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2510  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.4 
 
 
472 aa  312  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0791346  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.63 
 
 
480 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2805  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.78 
 
 
478 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.228775  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1444  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.47 
 
 
459 aa  310  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.85 
 
 
456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.01 
 
 
456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.85 
 
 
456 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0775  helix-turn-helix, Fis-type  41.6 
 
 
457 aa  309  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2897  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.84 
 
 
473 aa  308  9e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1956  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator FleR  41.45 
 
 
471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.75595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002813  flagellar regulatory protein FleQ  43.31 
 
 
469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.47 
 
 
454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03164  hypothetical protein  42.78 
 
 
469 aa  305  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2310  sigma-54 dependent response regulator  42.15 
 
 
478 aa  305  7e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.58 
 
 
460 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.34 
 
 
457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.6 
 
 
457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3079  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.03 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00177638  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1500  flagellar regulatory protein C  42.52 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1003  nitrogen regulation protein NR(I)  42.89 
 
 
481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2299  response regulator receiver protein  40.72 
 
 
446 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.65 
 
 
456 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1616  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.24 
 
 
452 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  42.9 
 
 
472 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1999  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.95 
 
 
481 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3230  flagellar regulatory protein C  42.43 
 
 
446 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.89 
 
 
497 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1364  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.74 
 
 
447 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.885668  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.62 
 
 
461 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000196128  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3049  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.3 
 
 
447 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 
476 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4192  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.73 
 
 
454 aa  298  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00227342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 
470 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3450  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.93 
 
 
448 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.05 
 
 
486 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1435  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.62 
 
 
447 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2938  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.62 
 
 
447 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3068  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.89 
 
 
452 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.94 
 
 
470 aa  296  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1347  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.89 
 
 
446 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1322  sigma-54 factor, interaction region  41.25 
 
 
446 aa  296  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.59 
 
 
453 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2928  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.35 
 
 
447 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0372  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.33 
 
 
461 aa  295  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  42.3 
 
 
461 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1280  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.62 
 
 
446 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  42.3 
 
 
461 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.3 
 
 
461 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02891  flagellar regulatory protein C  40.68 
 
 
445 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2345  two component signal transduction response regulator  41.71 
 
 
455 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3070  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.35 
 
 
447 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  42.3 
 
 
461 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  42.3 
 
 
461 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  42.3 
 
 
461 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1028  response regulator receiver protein  38.76 
 
 
439 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163891  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3302  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.05 
 
 
472 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.334689  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1359  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.28 
 
 
450 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.594792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1698  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.95 
 
 
457 aa  292  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000740904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.98 
 
 
464 aa  293  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1726  hypothetical protein  41.21 
 
 
437 aa  293  5e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1028  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  38.68 
 
 
468 aa  293  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.070914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3903  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.82 
 
 
455 aa  292  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000574971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62540  two-component response regulator CbrB  40.78 
 
 
478 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349279  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  38.61 
 
 
470 aa  292  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0753  sigma-54 dependent response regulator  40.58 
 
 
387 aa  291  1e-77  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1726  hypothetical protein  41.21 
 
 
437 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2361  two component sigma-54 specific, transcriptional regulator, Fis famliy  40.84 
 
 
449 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.42 
 
 
457 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03284  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator, Fis family protein  40.93 
 
 
453 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1105  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.7 
 
 
475 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926771  normal  0.835973 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.92 
 
 
473 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  38.61 
 
 
470 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  0.0000322182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3589  two-component response regulator CbrB  41.09 
 
 
477 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.92 
 
 
473 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.21 
 
 
457 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.92 
 
 
473 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.69 
 
 
446 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.598769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>