More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0846 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0846  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  100 
 
 
384 aa  768    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.124492  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1462  putative alkyl-dihydroxyacetone phosphate synthase  78.96 
 
 
433 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1459  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  71.65 
 
 
380 aa  545  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1168  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  70.91 
 
 
433 aa  525  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1043  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  70.39 
 
 
433 aa  527  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0366555  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0764  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  70.91 
 
 
433 aa  526  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00454819  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0526  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  69.09 
 
 
429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0637  response regulator receiver domain-containing protein  65.09 
 
 
384 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00837548  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0320  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  63.71 
 
 
385 aa  503  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4272  two-component response regulator  42.82 
 
 
470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.93 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2827  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.73 
 
 
470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3302  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.22 
 
 
472 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.334689  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50180  two-component response regulator  42.04 
 
 
473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  hitchhiker  0.00555849 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1719  flagellar regulatory protein C  42.6 
 
 
479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0473988  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002813  flagellar regulatory protein FleQ  43.12 
 
 
469 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1347  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.6 
 
 
446 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3696  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.47 
 
 
458 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12736  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4191  nitrogen regulation protein NR(I)  41.27 
 
 
470 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.500264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  41.01 
 
 
470 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1956  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator FleR  41.82 
 
 
471 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.75595  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0025  nitrogen regulation protein NR(I)  41.27 
 
 
470 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  41.01 
 
 
470 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.08 
 
 
446 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.598769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2897  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.69 
 
 
473 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3459  helix-turn-helix, Fis-type  42.6 
 
 
471 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.41 
 
 
463 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0027  nitrogen regulation protein NR(I)  41.27 
 
 
470 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.307133  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1129  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  43.08 
 
 
453 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2310  sigma-54 dependent response regulator  42.04 
 
 
478 aa  300  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03164  hypothetical protein  42.6 
 
 
469 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  42.38 
 
 
461 aa  300  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03753  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with GlnL: response regulator/sigma54 interaction protein  40.79 
 
 
469 aa  299  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1698  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.3 
 
 
457 aa  299  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000740904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1999  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.31 
 
 
481 aa  299  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4253  nitrogen regulation protein NR(I)  40.74 
 
 
472 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.177692  normal  0.167125 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03702  hypothetical protein  40.79 
 
 
469 aa  299  5e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1364  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.67 
 
 
447 aa  299  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.885668  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5314  nitrogen regulation protein NR(I)  40.74 
 
 
472 aa  299  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.111299  normal  0.738695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4118  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  40.74 
 
 
469 aa  299  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4344  nitrogen regulation protein NR(I)  40.79 
 
 
469 aa  299  6e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4333  nitrogen regulation protein NR(I)  41.05 
 
 
469 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  41.05 
 
 
469 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  41.05 
 
 
469 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4216  nitrogen regulation protein NR(I)  41.05 
 
 
469 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295301  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02891  flagellar regulatory protein C  42.82 
 
 
445 aa  299  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3672  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  40.1 
 
 
504 aa  299  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002131  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  41.05 
 
 
469 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  41.32 
 
 
470 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  42.38 
 
 
461 aa  299  7e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.38 
 
 
461 aa  299  7e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  42.38 
 
 
461 aa  299  7e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1534  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.73 
 
 
463 aa  299  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  42.38 
 
 
461 aa  299  7e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4148  nitrogen regulation protein NR(I)  40.79 
 
 
469 aa  299  7e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4390  nitrogen regulation protein NR(I)  40.79 
 
 
469 aa  299  7e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  42.38 
 
 
461 aa  298  8e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  41.05 
 
 
470 aa  298  9e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4095  nitrogen regulation protein NR(I)  40.79 
 
 
469 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0085  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.75 
 
 
452 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3230  flagellar regulatory protein C  41.82 
 
 
446 aa  298  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2928  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.82 
 
 
447 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0812  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.99 
 
 
453 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  hitchhiker  0.00000328811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.83 
 
 
467 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.78 
 
 
457 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1280  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.08 
 
 
446 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40 
 
 
460 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.23 
 
 
456 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.49 
 
 
461 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1435  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.56 
 
 
447 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4098  nitrogen regulation protein NR(I)  41.05 
 
 
470 aa  296  5e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.15 
 
 
454 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.57 
 
 
469 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3070  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.82 
 
 
447 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2938  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.56 
 
 
447 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  40.48 
 
 
470 aa  296  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  0.0000322182 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3647  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.78 
 
 
451 aa  296  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2398  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.57 
 
 
469 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1405  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.97 
 
 
478 aa  295  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000117702 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0320  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  41.47 
 
 
470 aa  295  9e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0371  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  41.73 
 
 
470 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4371  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.47 
 
 
451 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0775  helix-turn-helix, Fis-type  40.41 
 
 
457 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.3 
 
 
451 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190196  normal  0.699272 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.58 
 
 
460 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03284  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator, Fis family protein  40.89 
 
 
453 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0916  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.5 
 
 
480 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.73 
 
 
461 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000196128  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2805  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.7 
 
 
478 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.228775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.93 
 
 
455 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1444  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.15 
 
 
459 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2563  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.78 
 
 
480 aa  292  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  43.28 
 
 
472 aa  293  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3458  nitrogen regulation protein NR(I)  41.05 
 
 
466 aa  292  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00165612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4472  nitrogen regulation protein NR(I)  41.62 
 
 
471 aa  292  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1179  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.58 
 
 
457 aa  292  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.655382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1777  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.3 
 
 
465 aa  292  8e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0266  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  41.21 
 
 
470 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.649687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.28 
 
 
497 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0266  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  41.21 
 
 
470 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>