More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2879 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2879  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2404  LuxR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1050  LuxR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0346047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0213  LuxR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 250 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00305368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6653  two component LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879715  hitchhiker  0.00000102566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4070  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  44.07 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  44.07 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  47.54 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  44.07 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  44.07 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  44.07 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  44.07 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  44.07 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  44.07 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  50.85 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2255  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0808718  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0355  two component LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26570  putative transcriptional regulator  38.27 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.604718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0354  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0630  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.210211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  49.09 
 
 		 265 aa  51.6  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04243  DNA-binding transcriptional activator  45.76 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0432345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3631  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00452114  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0319702  normal  0.0827208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4960  DNA-binding transcriptional activator BglJ  45.76 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013279  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  43.64 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04209  hypothetical protein  45.76 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4912  DNA-binding transcriptional activator BglJ  45.76 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000035455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5879  DNA-binding transcriptional activator BglJ  45.76 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0356322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  49.09 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4599  DNA-binding transcriptional activator BglJ  45.76 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3689  DNA-binding transcriptional activator BglJ  45.76 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.256974  decreased coverage  0.00000689885 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3939  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 300 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1861  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.419693  normal  0.0598663 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4964  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2960  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.917749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3033  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.011043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3078  response regulator transcription regulator protein  45.76 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0498276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  43.64 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0524  DNA-binding transcriptional activator BglJ  42.86 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.441884  decreased coverage  0.00182445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4962  DNA-binding transcriptional activator BglJ  44.07 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.793457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4869  DNA-binding transcriptional activator BglJ  45.1 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0232651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4956  DNA-binding transcriptional activator BglJ  45.1 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 275 aa  48.9  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4801  DNA-binding transcriptional activator BglJ  45.1 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.564373  normal  0.609809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4904  DNA-binding transcriptional activator BglJ  45.1 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.53459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 269 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  35.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  35.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  35.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  35.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  35.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  35.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0828785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  35.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  35.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 229 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3104  LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  41.82 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  41.82 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3388  two-component response regulator transcription regulator protein  44.44 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0201761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  38.89 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  51.92 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264008  normal  0.348846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  40 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  40.38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  40.38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4121  DNA-binding transcriptional activator UhpA  40 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  40.38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  40.38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  40.38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4016  DNA-binding transcriptional activator UhpA  40 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  40.38 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>