More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0121 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 
255 aa  194  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0228145  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 
264 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
264 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
256 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
262 aa  158  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  37.5 
 
 
254 aa  156  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
274 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
252 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
253 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.033772  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
252 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
256 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
253 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
254 aa  148  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
249 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
269 aa  142  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
249 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
293 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
248 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.92 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
249 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
284 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
284 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
253 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.143298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
284 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3267  putative short chain dehydrogenase/reductase  37.7 
 
 
249 aa  131  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
248 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
249 aa  131  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0128368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.75 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.86 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.47 
 
 
248 aa  129  6e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.68 
 
 
296 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3281  hypothetical protein  34.52 
 
 
250 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0804235  normal  0.138859 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.34 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.74 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2292  short-chain dehydrogenase/reductase, oxidoreductase  35.43 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.253121  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.97 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
242 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
249 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
288 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
239 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.05 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  36.14 
 
 
247 aa  125  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  36.14 
 
 
250 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
251 aa  125  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
251 aa  125  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
252 aa  125  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
246 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2744  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 
334 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
291 aa  125  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
248 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2004  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.108608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.63 
 
 
257 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0497  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.86 
 
 
245 aa  125  9e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 
317 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.46 
 
 
306 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
288 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
288 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
288 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2721  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
249 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
288 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
288 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
239 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.46 
 
 
247 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
282 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
239 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
288 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.6 
 
 
250 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
249 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  36.22 
 
 
245 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
249 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
288 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 
288 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
284 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
248 aa  122  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  36.11 
 
 
257 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  33.07 
 
 
297 aa  123  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
286 aa  122  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>