120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3126 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3126  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
177 aa  366  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  29.52 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  26.76 
 
 
326 aa  67.8  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  26.14 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  27.33 
 
 
314 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  26.06 
 
 
287 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  26.06 
 
 
316 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  26.57 
 
 
315 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  26.9 
 
 
312 aa  58.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  27.46 
 
 
241 aa  57.8  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  27.66 
 
 
312 aa  58.2  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  25 
 
 
313 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  26.24 
 
 
323 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  25.9 
 
 
232 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  27.34 
 
 
322 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  26.57 
 
 
241 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  23.95 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  25.85 
 
 
323 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  25.56 
 
 
316 aa  55.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  26.24 
 
 
321 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  25.69 
 
 
251 aa  55.1  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  24.24 
 
 
232 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  29.41 
 
 
234 aa  54.7  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  30.2 
 
 
236 aa  54.7  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2713  hypothetical protein  41.82 
 
 
102 aa  54.3  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  28.87 
 
 
253 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  24.14 
 
 
245 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  28.17 
 
 
253 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  24.31 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  27.21 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  23.29 
 
 
325 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  29.41 
 
 
236 aa  52.4  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  23.13 
 
 
295 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  22.97 
 
 
323 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  23.74 
 
 
255 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  26.67 
 
 
334 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  23.74 
 
 
233 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  26.21 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  25.18 
 
 
221 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  23.24 
 
 
241 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  28.47 
 
 
304 aa  52  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  26.83 
 
 
325 aa  52  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  26.75 
 
 
326 aa  51.6  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  30.28 
 
 
323 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  25.85 
 
 
319 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  24.14 
 
 
234 aa  51.6  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  23.24 
 
 
241 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  25.74 
 
 
333 aa  51.2  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  23.74 
 
 
231 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  23.13 
 
 
250 aa  51.2  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  23.24 
 
 
180 aa  50.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  22.38 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  22.6 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  22.54 
 
 
250 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  24.48 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  25.55 
 
 
248 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  25.55 
 
 
248 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  22.38 
 
 
336 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  24.64 
 
 
235 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  22.6 
 
 
325 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  22.76 
 
 
230 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  23.19 
 
 
216 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  23.45 
 
 
236 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  22.76 
 
 
230 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  22.76 
 
 
230 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  23.53 
 
 
230 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  23.33 
 
 
321 aa  47.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  23.74 
 
 
506 aa  47.8  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  24.24 
 
 
318 aa  47.8  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  23.33 
 
 
327 aa  47.8  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  23.03 
 
 
160 aa  47.8  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  23.53 
 
 
321 aa  47.8  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  23.33 
 
 
321 aa  47.8  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  28.67 
 
 
192 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  23.19 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  27.97 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  23.33 
 
 
321 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  23.33 
 
 
321 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  26.51 
 
 
335 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  23.74 
 
 
222 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  24.44 
 
 
319 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  23.81 
 
 
321 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  23.81 
 
 
321 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  25.36 
 
 
239 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  26.52 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  27.07 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  22.3 
 
 
336 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  23.81 
 
 
321 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  23.31 
 
 
321 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  24.1 
 
 
335 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  23.24 
 
 
316 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  25 
 
 
277 aa  45.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  23.13 
 
 
340 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  23.4 
 
 
321 aa  44.7  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  22.3 
 
 
321 aa  44.7  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  23.24 
 
 
321 aa  44.3  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  23.81 
 
 
320 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  22.92 
 
 
236 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  25.17 
 
 
277 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>