More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3941 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0082  gamma-glutamyl kinase  90.71 
 
 		 366 aa  678    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4424  gamma-glutamyl kinase  89.62 
 
 		 366 aa  669    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3848  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 368 aa  764    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3941  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 368 aa  764    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4284  gamma-glutamyl kinase  89.62 
 
 		 366 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4237  gamma-glutamyl kinase  89.62 
 
 		 366 aa  669    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0116  gamma-glutamyl kinase  89.07 
 
 		 366 aa  665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4056  gamma-glutamyl kinase  99.46 
 
 		 368 aa  760    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3014  gamma-glutamyl kinase  79.44 
 
 		 366 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0763  gamma-glutamyl kinase  77.17 
 
 		 368 aa  585  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0150  gamma-glutamyl kinase  77.35 
 
 		 369 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4146  gamma-glutamyl kinase  69.72 
 
 		 368 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01674  gamma-glutamyl kinase  68.12 
 
 		 369 aa  514  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000140445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  48.53 
 
 		 365 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4832  gamma-glutamyl kinase  45.54 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04032  gamma-glutamyl kinase  46.69 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00343  gamma-glutamyl kinase  40.76 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000428896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  39.7 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 369 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  37.36 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2721  gamma-glutamyl kinase  41.67 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  36.16 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  35.34 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  35.34 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  35.34 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  35.34 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  35.93 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  38.04 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  37.69 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  36.42 
 
 		 379 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  36.11 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  39.33 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0320  gamma-glutamyl kinase  40.72 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00950173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  38.21 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0290  gamma-glutamyl kinase  40.72 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000240512  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 		 374 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  37.87 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  34.71 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  37.83 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  39.94 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  35.67 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  38.33 
 
 		 379 aa  222  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  34.85 
 
 		 370 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  37.31 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36.42 
 
 		 373 aa  219  7.999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  37.91 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  37 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  35.5 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  34.79 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  37.65 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  34.52 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  34.94 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  38.3 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  36.54 
 
 		 378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  34.52 
 
 		 372 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  36.24 
 
 		 371 aa  215  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  34.52 
 
 		 372 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  34.52 
 
 		 372 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  34.95 
 
 		 373 aa  215  9e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  38.01 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  36.08 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  36.64 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  33.89 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  33.89 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  33.89 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  33.89 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  33.89 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  33.89 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  33.89 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  33.89 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  35.51 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  33.89 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  38.46 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  33.88 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  33.88 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  34.05 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  36.89 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  33.52 
 
 		 369 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  32.7 
 
 		 367 aa  210  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  35.65 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  34.55 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  34.89 
 
 		 374 aa  209  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  36.14 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  35.84 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  38.21 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  38.21 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  35.15 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  34.66 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  35.84 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  37.46 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  37.77 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  34.66 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  37.87 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  34.66 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  37.57 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  34.78 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  34.95 
 
 		 375 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  37.57 
 
 		 372 aa  205  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>