More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04032 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_04032  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
365 aa  747    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  65.11 
 
 
365 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4832  gamma-glutamyl kinase  51.09 
 
 
365 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00343  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 
384 aa  330  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000428896  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4146  gamma-glutamyl kinase  49.71 
 
 
368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2721  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 
385 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4237  gamma-glutamyl kinase  45.48 
 
 
366 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4424  gamma-glutamyl kinase  45.48 
 
 
366 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4284  gamma-glutamyl kinase  45.48 
 
 
366 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0116  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3848  gamma-glutamyl kinase  46.69 
 
 
368 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3941  gamma-glutamyl kinase  46.69 
 
 
368 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0763  gamma-glutamyl kinase  47.55 
 
 
368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0082  gamma-glutamyl kinase  46.69 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3014  gamma-glutamyl kinase  46.18 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4056  gamma-glutamyl kinase  46.4 
 
 
368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01674  gamma-glutamyl kinase  46.89 
 
 
369 aa  295  7e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000140445  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0290  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 
384 aa  292  6e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000240512  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0320  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 
384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00950173  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  43.17 
 
 
377 aa  288  8e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
372 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
372 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
372 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  44.6 
 
 
363 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 
376 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
372 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  40.33 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  42.16 
 
 
370 aa  282  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  42.03 
 
 
369 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  43.72 
 
 
373 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  43.65 
 
 
393 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  41.21 
 
 
379 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  41.19 
 
 
372 aa  279  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  41.62 
 
 
383 aa  279  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  41.76 
 
 
390 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  39.84 
 
 
372 aa  275  7e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  41.05 
 
 
369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0150  gamma-glutamyl kinase  48.89 
 
 
369 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
373 aa  272  6e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
367 aa  272  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  41.6 
 
 
378 aa  272  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  40.77 
 
 
367 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  40.77 
 
 
367 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  40.77 
 
 
367 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  40.77 
 
 
367 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  40.77 
 
 
367 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  40.66 
 
 
367 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  40.77 
 
 
367 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  40.55 
 
 
371 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  40.77 
 
 
367 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  40.77 
 
 
367 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  40.77 
 
 
367 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  43.8 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  39.84 
 
 
372 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  40.05 
 
 
370 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  40.54 
 
 
374 aa  268  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  40.22 
 
 
367 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  40.22 
 
 
367 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  40.22 
 
 
367 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  40.22 
 
 
367 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  40.22 
 
 
367 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  40.77 
 
 
373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  43.41 
 
 
374 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  41.73 
 
 
372 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  41.19 
 
 
372 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  41.19 
 
 
372 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  41.96 
 
 
376 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  41.32 
 
 
369 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  41.6 
 
 
372 aa  263  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  40.92 
 
 
372 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  40.92 
 
 
372 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  40.55 
 
 
367 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  40 
 
 
373 aa  262  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
371 aa  262  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  42.23 
 
 
376 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  39.12 
 
 
367 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  41.69 
 
 
376 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  40.93 
 
 
374 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  41.8 
 
 
392 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
372 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  41.92 
 
 
377 aa  257  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  40.11 
 
 
392 aa  256  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  39.73 
 
 
387 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  41.8 
 
 
385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  41 
 
 
367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  42.3 
 
 
373 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2272  gamma-glutamyl kinase  43.51 
 
 
370 aa  252  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  39.45 
 
 
390 aa  252  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  40.66 
 
 
389 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  40.05 
 
 
376 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  42.15 
 
 
372 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  39.84 
 
 
389 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  39.14 
 
 
387 aa  250  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  41.32 
 
 
373 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  40.6 
 
 
379 aa  249  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  42.02 
 
 
373 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  42.27 
 
 
370 aa  249  7e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  40.6 
 
 
378 aa  248  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  39.56 
 
 
393 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  41.05 
 
 
378 aa  247  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>