More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0116 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0116  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
366 aa  756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4424  gamma-glutamyl kinase  99.45 
 
 
366 aa  753    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4237  gamma-glutamyl kinase  99.45 
 
 
366 aa  753    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0082  gamma-glutamyl kinase  89.07 
 
 
366 aa  667    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4284  gamma-glutamyl kinase  99.45 
 
 
366 aa  753    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3848  gamma-glutamyl kinase  89.07 
 
 
368 aa  666    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3941  gamma-glutamyl kinase  89.07 
 
 
368 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4056  gamma-glutamyl kinase  88.8 
 
 
368 aa  664    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0763  gamma-glutamyl kinase  79.51 
 
 
368 aa  594  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3014  gamma-glutamyl kinase  78.42 
 
 
366 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0150  gamma-glutamyl kinase  77.66 
 
 
369 aa  558  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4146  gamma-glutamyl kinase  69.81 
 
 
368 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01674  gamma-glutamyl kinase  66.76 
 
 
369 aa  503  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000140445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  48.82 
 
 
365 aa  320  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04032  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 
365 aa  290  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4832  gamma-glutamyl kinase  41.16 
 
 
365 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00343  gamma-glutamyl kinase  40.92 
 
 
384 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000428896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  38.19 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  36.91 
 
 
373 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2721  gamma-glutamyl kinase  41.35 
 
 
385 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  36.81 
 
 
373 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0320  gamma-glutamyl kinase  38.15 
 
 
384 aa  236  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00950173  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0290  gamma-glutamyl kinase  38.15 
 
 
384 aa  236  6e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000240512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  34.81 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  34.25 
 
 
372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  34.52 
 
 
372 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  35.71 
 
 
376 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  38.11 
 
 
370 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  37.9 
 
 
377 aa  229  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  34.52 
 
 
374 aa  228  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  33.42 
 
 
372 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  33.42 
 
 
372 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  33.42 
 
 
372 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  35.51 
 
 
393 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  33.42 
 
 
372 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  33.06 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  35.52 
 
 
372 aa  226  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  37.32 
 
 
374 aa  225  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  36.9 
 
 
378 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  37.5 
 
 
376 aa  223  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  36.59 
 
 
378 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  37.64 
 
 
373 aa  222  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  36.67 
 
 
379 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  36.26 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  34.16 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  35.51 
 
 
378 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  37.1 
 
 
371 aa  219  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  37.09 
 
 
372 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  38.07 
 
 
374 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  36.39 
 
 
373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  36.61 
 
 
383 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  33.05 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  33.05 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  33.05 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  33.05 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  33.05 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  36.6 
 
 
371 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  33.05 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  34.34 
 
 
372 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  33.05 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  33.05 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  33.05 
 
 
367 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  37.2 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  33.06 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  36.31 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  36.31 
 
 
380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  32.23 
 
 
370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  33.06 
 
 
372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  34.04 
 
 
373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  35.71 
 
 
373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  36.31 
 
 
380 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  32.04 
 
 
367 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  35.44 
 
 
372 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  37.1 
 
 
372 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  32.35 
 
 
376 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  37.61 
 
 
372 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  37.61 
 
 
372 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  36.52 
 
 
372 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  34.07 
 
 
374 aa  209  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  34.65 
 
 
366 aa  208  9e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  37.91 
 
 
372 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  37.91 
 
 
372 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  37.91 
 
 
372 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  34.89 
 
 
372 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  34.69 
 
 
382 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  31.65 
 
 
367 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  35.86 
 
 
374 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  37.15 
 
 
373 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  36.84 
 
 
373 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  31.65 
 
 
367 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  35.57 
 
 
378 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  31.65 
 
 
367 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  31.65 
 
 
367 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  36.52 
 
 
372 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  31.65 
 
 
367 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  33.24 
 
 
373 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  33.94 
 
 
368 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  32.88 
 
 
372 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  32.88 
 
 
372 aa  206  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>