More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0773 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  83.99 
 
 
382 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  99.74 
 
 
380 aa  754    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  87.5 
 
 
380 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  86.93 
 
 
379 aa  651    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
380 aa  756    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  83.24 
 
 
378 aa  633  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3672  gamma-glutamyl kinase  88.62 
 
 
379 aa  634  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.039065  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  83.69 
 
 
378 aa  627  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  83.16 
 
 
378 aa  627  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  80.32 
 
 
372 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  78.93 
 
 
372 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  70.32 
 
 
372 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  71.39 
 
 
372 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  71.66 
 
 
372 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  71.28 
 
 
372 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  71.66 
 
 
394 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  71.66 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  70.86 
 
 
372 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  71.66 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  71.66 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  71.66 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  71.66 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  71.66 
 
 
372 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  71.66 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  70.59 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  70.59 
 
 
372 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  71.39 
 
 
372 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  70.59 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  70.59 
 
 
372 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  71.01 
 
 
374 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  70.59 
 
 
372 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  70.21 
 
 
372 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  70.48 
 
 
374 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  64.63 
 
 
372 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  70.32 
 
 
374 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  64.89 
 
 
372 aa  485  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  66.84 
 
 
374 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  63.56 
 
 
372 aa  478  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  65.68 
 
 
371 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  57.95 
 
 
374 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  58.45 
 
 
390 aa  424  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  60.05 
 
 
378 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  58.06 
 
 
376 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  57.99 
 
 
368 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  56.91 
 
 
372 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  56.64 
 
 
372 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  53.48 
 
 
376 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  57.45 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  57.99 
 
 
372 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  56.15 
 
 
375 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  59.03 
 
 
380 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  56.91 
 
 
372 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  57.18 
 
 
372 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  54.4 
 
 
376 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  54.4 
 
 
376 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  56.37 
 
 
372 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  53.35 
 
 
373 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  56.1 
 
 
372 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  54.47 
 
 
374 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  55.44 
 
 
373 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  56.37 
 
 
372 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  53.16 
 
 
376 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  56.1 
 
 
372 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  56.45 
 
 
374 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  67.18 
 
 
260 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0215  glutamate 5-kinase  65.77 
 
 
260 aa  332  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.256743 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1600  gamma-glutamyl kinase  49.2 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157762  hitchhiker  0.000100305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  49.06 
 
 
373 aa  325  9e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  48.81 
 
 
376 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  46.95 
 
 
390 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  47.21 
 
 
373 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  50.13 
 
 
374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1682  gamma-glutamyl kinase  48.92 
 
 
390 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1503  gamma-glutamyl kinase  48.65 
 
 
390 aa  311  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1783  glutamate 5-kinase  49.87 
 
 
383 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00674296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1460  glutamate 5-kinase  49.87 
 
 
399 aa  309  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  47.61 
 
 
387 aa  308  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  47.59 
 
 
378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  46.47 
 
 
372 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  46.54 
 
 
373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  46.87 
 
 
370 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  41.58 
 
 
373 aa  299  6e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  44.86 
 
 
392 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
373 aa  297  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  47.48 
 
 
373 aa  295  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  47.96 
 
 
393 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
373 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  44.89 
 
 
383 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  47.51 
 
 
373 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  45.11 
 
 
366 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  46.96 
 
 
373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  44.86 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  44.86 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  44.86 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  44.86 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  44.86 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  44.86 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  44.86 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>