More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01674 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01674  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 369 aa  765    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000140445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4146  gamma-glutamyl kinase  73.17 
 
 		 368 aa  578  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3848  gamma-glutamyl kinase  68.94 
 
 		 368 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3941  gamma-glutamyl kinase  68.94 
 
 		 368 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4056  gamma-glutamyl kinase  68.94 
 
 		 368 aa  524  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4284  gamma-glutamyl kinase  68.12 
 
 		 366 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3014  gamma-glutamyl kinase  68.39 
 
 		 366 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4237  gamma-glutamyl kinase  68.12 
 
 		 366 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4424  gamma-glutamyl kinase  68.12 
 
 		 366 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0082  gamma-glutamyl kinase  67.57 
 
 		 366 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0116  gamma-glutamyl kinase  67.57 
 
 		 366 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0763  gamma-glutamyl kinase  67.39 
 
 		 368 aa  511  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0150  gamma-glutamyl kinase  70.3 
 
 		 369 aa  501  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  50.29 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4832  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04032  gamma-glutamyl kinase  47.84 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00343  gamma-glutamyl kinase  39.37 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000428896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  37.68 
 
 		 369 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0290  gamma-glutamyl kinase  41.4 
 
 		 384 aa  238  9e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000240512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2721  gamma-glutamyl kinase  42.41 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0320  gamma-glutamyl kinase  41.4 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00950173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  36.86 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  36.29 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  36.29 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  36.29 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  36.29 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  36.29 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  36.47 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  36.39 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  35.71 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  34.9 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  36.54 
 
 		 373 aa  223  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  35.26 
 
 		 379 aa  223  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  37.01 
 
 		 373 aa  222  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  36.26 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  37.5 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  33.98 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  35.41 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  36.13 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  35.41 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  35.41 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  37.14 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  35.41 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  35.41 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  35.41 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  35.41 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  35.41 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  35.41 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  35.41 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  37.14 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  37.32 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  36.68 
 
 		 373 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  34.28 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  35.41 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  34.28 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  34.28 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  34.28 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  34.28 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  37.87 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36.78 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  36.86 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  36.86 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  36.26 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  33.9 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  34.56 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  36.92 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  35.45 
 
 		 370 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  36.67 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  35.85 
 
 		 372 aa  206  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  34.65 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  35.13 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  36.34 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  35.13 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  35.13 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  35.13 
 
 		 367 aa  203  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  37.69 
 
 		 373 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  36.21 
 
 		 390 aa  202  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  35.13 
 
 		 367 aa  202  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  35.06 
 
 		 371 aa  202  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  34.59 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  36.1 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  34.97 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  36.13 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  35.05 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  34.2 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  35.03 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  34.75 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  35.28 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  33.62 
 
 		 369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  35.59 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  36.05 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  34.46 
 
 		 379 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  34.46 
 
 		 383 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  32.49 
 
 		 372 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  35.17 
 
 		 375 aa  199  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  32.49 
 
 		 372 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  34.15 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  33.15 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  36.05 
 
 		 372 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  34.01 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>