More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4146 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4146  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 368 aa  759    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01674  gamma-glutamyl kinase  72.9 
 
 		 369 aa  558  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000140445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4424  gamma-glutamyl kinase  70.36 
 
 		 366 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4237  gamma-glutamyl kinase  70.36 
 
 		 366 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4284  gamma-glutamyl kinase  70.36 
 
 		 366 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0763  gamma-glutamyl kinase  70.3 
 
 		 368 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0116  gamma-glutamyl kinase  69.81 
 
 		 366 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3848  gamma-glutamyl kinase  69.72 
 
 		 368 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3941  gamma-glutamyl kinase  69.72 
 
 		 368 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4056  gamma-glutamyl kinase  69.44 
 
 		 368 aa  529  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0082  gamma-glutamyl kinase  68.31 
 
 		 366 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3014  gamma-glutamyl kinase  68.23 
 
 		 366 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0150  gamma-glutamyl kinase  70.6 
 
 		 369 aa  495  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4832  gamma-glutamyl kinase  44.48 
 
 		 365 aa  315  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04032  gamma-glutamyl kinase  49.71 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00343  gamma-glutamyl kinase  41.95 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000428896  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0290  gamma-glutamyl kinase  41.26 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000240512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2721  gamma-glutamyl kinase  41.99 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  37.33 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  37.33 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0320  gamma-glutamyl kinase  40.97 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00950173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  39.41 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  37.33 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  37.33 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  37.2 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  39.64 
 
 		 372 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  37.68 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  36.07 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  36.51 
 
 		 374 aa  236  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  38.95 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  37.23 
 
 		 376 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  35.41 
 
 		 379 aa  232  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  37.23 
 
 		 373 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  36.96 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  37.61 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  39.4 
 
 		 373 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  37.03 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  39.52 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  38.1 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  36.21 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  36.21 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  36.26 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  38.33 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  35.6 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  35.1 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  35.1 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  35.1 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  35.1 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  35.1 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  39.7 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  35.24 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  36.78 
 
 		 372 aa  215  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  35.1 
 
 		 367 aa  215  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  36.68 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  36.41 
 
 		 372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36.11 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  35.74 
 
 		 366 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  38.4 
 
 		 371 aa  212  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  36.39 
 
 		 372 aa  212  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  36.39 
 
 		 372 aa  212  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  37.23 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  36.89 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  36.93 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  37.9 
 
 		 379 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  36.68 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  34.08 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  37.83 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  38.14 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  37.13 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  34.05 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2731  gamma-glutamyl kinase  38.14 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.681292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  37.84 
 
 		 386 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  37.12 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  36.34 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  35.22 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2782  gamma-glutamyl kinase  37.84 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  38.74 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 		 374 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  35.65 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2993  gamma-glutamyl kinase  37.84 
 
 		 367 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0371312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  38.14 
 
 		 367 aa  206  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  36.41 
 
 		 372 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2994  gamma-glutamyl kinase  39.04 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.13461  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  35.65 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  35.1 
 
 		 367 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  33.78 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  35.34 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  39.7 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  37.58 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  39.7 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>