More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0320 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0320  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
384 aa  763    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00950173  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0290  gamma-glutamyl kinase  98.96 
 
 
384 aa  753    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000240512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00343  gamma-glutamyl kinase  77.72 
 
 
384 aa  554  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000428896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2721  gamma-glutamyl kinase  73.94 
 
 
385 aa  518  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 
365 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04032  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 
365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4832  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
365 aa  308  9e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  41.03 
 
 
372 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  46.13 
 
 
373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  44.36 
 
 
390 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 
370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  42.09 
 
 
370 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  42.2 
 
 
369 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  46.68 
 
 
376 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 
369 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  41.13 
 
 
372 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
373 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  40.91 
 
 
373 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.17 
 
 
376 aa  275  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  40.86 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  40.86 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  40.86 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  40.86 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.8 
 
 
375 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  45.72 
 
 
368 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.26 
 
 
372 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.26 
 
 
372 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  46.9 
 
 
376 aa  272  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  41.6 
 
 
379 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  41.08 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  42.11 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  42.82 
 
 
383 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  44.57 
 
 
377 aa  270  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  41.47 
 
 
376 aa  269  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  45.28 
 
 
373 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  41.4 
 
 
372 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  41.33 
 
 
373 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
367 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  43.17 
 
 
367 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
378 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
367 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
367 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
367 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
367 aa  266  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
367 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  43.17 
 
 
367 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  43.17 
 
 
367 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4146  gamma-glutamyl kinase  41.26 
 
 
368 aa  266  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  40.86 
 
 
374 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 
372 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  42.93 
 
 
367 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  41.33 
 
 
373 aa  265  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  42.78 
 
 
367 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  42.25 
 
 
369 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  45.41 
 
 
363 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  40.63 
 
 
373 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
367 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  45.41 
 
 
371 aa  263  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  41.53 
 
 
374 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 
367 aa  262  6.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 
374 aa  262  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  42.33 
 
 
393 aa  262  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  41.58 
 
 
376 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  42.55 
 
 
375 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.59 
 
 
390 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  44.72 
 
 
372 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  38.48 
 
 
369 aa  259  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  44.72 
 
 
372 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  44.85 
 
 
380 aa  259  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  44.72 
 
 
372 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  40.86 
 
 
372 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  45.68 
 
 
372 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  40.86 
 
 
372 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  40.86 
 
 
372 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  40.86 
 
 
372 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  44.72 
 
 
372 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  40.32 
 
 
372 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  41.53 
 
 
374 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  45.07 
 
 
379 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  38.03 
 
 
373 aa  255  9e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  39.79 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  44.53 
 
 
383 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
378 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  44.53 
 
 
383 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  41.85 
 
 
367 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  41.69 
 
 
367 aa  252  9.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  42.93 
 
 
372 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  41.69 
 
 
367 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 
374 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  43.24 
 
 
372 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  40 
 
 
369 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  40.7 
 
 
376 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  42.51 
 
 
367 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>