More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0150 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0150  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 369 aa  759    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4424  gamma-glutamyl kinase  79.56 
 
 		 366 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4237  gamma-glutamyl kinase  79.56 
 
 		 366 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3014  gamma-glutamyl kinase  79.56 
 
 		 366 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4284  gamma-glutamyl kinase  79.56 
 
 		 366 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0116  gamma-glutamyl kinase  79.02 
 
 		 366 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0763  gamma-glutamyl kinase  79.56 
 
 		 368 aa  588  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3848  gamma-glutamyl kinase  78.73 
 
 		 368 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3941  gamma-glutamyl kinase  78.73 
 
 		 368 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4056  gamma-glutamyl kinase  78.73 
 
 		 368 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0082  gamma-glutamyl kinase  77.38 
 
 		 366 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4146  gamma-glutamyl kinase  71.7 
 
 		 368 aa  541  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01674  gamma-glutamyl kinase  70.3 
 
 		 369 aa  522  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000140445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  49.56 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4832  gamma-glutamyl kinase  44.88 
 
 		 365 aa  298  7e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04032  gamma-glutamyl kinase  49.21 
 
 		 365 aa  282  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 		 369 aa  239  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  36.16 
 
 		 379 aa  238  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  36.74 
 
 		 372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 372 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 372 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 372 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 372 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  37.5 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  37.96 
 
 		 390 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  37.05 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  38.02 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00343  gamma-glutamyl kinase  40.64 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000428896  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  40.12 
 
 		 374 aa  229  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  38.12 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  39.1 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  41.21 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  37.64 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  37.86 
 
 		 371 aa  226  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0320  gamma-glutamyl kinase  38.78 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00950173  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0290  gamma-glutamyl kinase  38.78 
 
 		 384 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000240512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  40.06 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2721  gamma-glutamyl kinase  40.38 
 
 		 385 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  36.11 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  38.71 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  38.86 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  40.23 
 
 		 372 aa  219  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  39.08 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  36.77 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  35.34 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  37.75 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  36.49 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  37.18 
 
 		 378 aa  216  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  35.73 
 
 		 376 aa  215  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  36.99 
 
 		 378 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  37.28 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  36.21 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  38.1 
 
 		 377 aa  212  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  35.56 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  37.2 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  35.9 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  35.8 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  36.78 
 
 		 378 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  37.54 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  39.42 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  40.06 
 
 		 372 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  40.06 
 
 		 372 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  40.06 
 
 		 372 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  35.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  35.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  35.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  35.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  35.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  35.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  35.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  35.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  35.52 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  39.71 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  35.69 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  37.54 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  39.47 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  39.04 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  39.47 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  34.63 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  39.13 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  38.58 
 
 		 382 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  36.56 
 
 		 376 aa  206  7e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  34.93 
 
 		 367 aa  205  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  36.75 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  39.77 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  38.51 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  39.71 
 
 		 372 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  38.53 
 
 		 372 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  34.33 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  34.33 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  34.33 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  34.33 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  37.43 
 
 		 372 aa  202  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  38.4 
 
 		 380 aa  202  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  34.33 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  36.56 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  38.4 
 
 		 380 aa  202  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>