More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00343 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00343  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
384 aa  751    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000428896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2721  gamma-glutamyl kinase  81.17 
 
 
385 aa  578  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0290  gamma-glutamyl kinase  77.72 
 
 
384 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000240512  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0320  gamma-glutamyl kinase  77.72 
 
 
384 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00950173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 
365 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04032  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 
365 aa  315  6e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4832  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
365 aa  313  4.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  47.68 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  47.48 
 
 
373 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  48.39 
 
 
376 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  45.84 
 
 
373 aa  296  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  41.94 
 
 
372 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  45.71 
 
 
393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  43.24 
 
 
370 aa  286  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  43.67 
 
 
372 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 
372 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 
370 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  43.36 
 
 
369 aa  280  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 
367 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  43.63 
 
 
379 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  45.43 
 
 
377 aa  277  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 
363 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  44.47 
 
 
372 aa  276  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  44.32 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  43.92 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.97 
 
 
383 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4146  gamma-glutamyl kinase  41.95 
 
 
368 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  48.34 
 
 
373 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  43.65 
 
 
378 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
374 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  45.74 
 
 
378 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
372 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  47.34 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  44.5 
 
 
372 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  46.05 
 
 
383 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  46.05 
 
 
383 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  46.79 
 
 
373 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  45.45 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  47.07 
 
 
372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  45.45 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
372 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
372 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  47.06 
 
 
368 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  46.65 
 
 
374 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
372 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 
371 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  45.58 
 
 
374 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  45.33 
 
 
367 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
378 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  42.59 
 
 
372 aa  265  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  44 
 
 
369 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  47.18 
 
 
374 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  47.51 
 
 
373 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 
382 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  45.65 
 
 
379 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
367 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  43.82 
 
 
372 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0082  gamma-glutamyl kinase  40.56 
 
 
366 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  46.38 
 
 
374 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  43.68 
 
 
374 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  45.04 
 
 
372 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 
367 aa  262  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  41.91 
 
 
373 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  44.36 
 
 
378 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  43.16 
 
 
372 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  45.04 
 
 
372 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  44.92 
 
 
390 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4284  gamma-glutamyl kinase  41.5 
 
 
366 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4424  gamma-glutamyl kinase  41.5 
 
 
366 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4237  gamma-glutamyl kinase  41.5 
 
 
366 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  44.56 
 
 
372 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  45.58 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  43.58 
 
 
375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  41.1 
 
 
369 aa  259  6e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  45.04 
 
 
372 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  40.05 
 
 
369 aa  258  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  40.85 
 
 
373 aa  258  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  44.85 
 
 
376 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  43.9 
 
 
379 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  43.35 
 
 
387 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  45.58 
 
 
372 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  45.58 
 
 
372 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  45.58 
 
 
372 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  45.58 
 
 
372 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  43.94 
 
 
367 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>