More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0082 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0082  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
366 aa  762    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4284  gamma-glutamyl kinase  89.62 
 
 
366 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4424  gamma-glutamyl kinase  89.62 
 
 
366 aa  669    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4237  gamma-glutamyl kinase  89.62 
 
 
366 aa  669    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3848  gamma-glutamyl kinase  90.71 
 
 
368 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3941  gamma-glutamyl kinase  90.71 
 
 
368 aa  677    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0116  gamma-glutamyl kinase  89.07 
 
 
366 aa  666    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4056  gamma-glutamyl kinase  90.71 
 
 
368 aa  676    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0763  gamma-glutamyl kinase  78.42 
 
 
368 aa  578  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3014  gamma-glutamyl kinase  77.05 
 
 
366 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0150  gamma-glutamyl kinase  76.02 
 
 
369 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4146  gamma-glutamyl kinase  68.31 
 
 
368 aa  536  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01674  gamma-glutamyl kinase  66.76 
 
 
369 aa  503  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000140445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  48.55 
 
 
365 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4832  gamma-glutamyl kinase  43.06 
 
 
365 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04032  gamma-glutamyl kinase  46.69 
 
 
365 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00343  gamma-glutamyl kinase  40.56 
 
 
384 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000428896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  37.09 
 
 
390 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  36.54 
 
 
373 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  38.6 
 
 
373 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2721  gamma-glutamyl kinase  40.71 
 
 
385 aa  235  9e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  36.9 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  36.83 
 
 
393 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  37.54 
 
 
377 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  38.39 
 
 
376 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0320  gamma-glutamyl kinase  39.82 
 
 
384 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00950173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  35.52 
 
 
379 aa  229  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0290  gamma-glutamyl kinase  39.82 
 
 
384 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000240512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  38.41 
 
 
370 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  37.87 
 
 
374 aa  227  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  37.92 
 
 
376 aa  226  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  34.26 
 
 
372 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  34.26 
 
 
372 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  34.26 
 
 
372 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  34.26 
 
 
372 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  38.51 
 
 
372 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  36.36 
 
 
372 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  36.12 
 
 
372 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  34.25 
 
 
367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  36.9 
 
 
378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  34.71 
 
 
374 aa  222  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  34.54 
 
 
372 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  37.39 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  38.72 
 
 
373 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  37.25 
 
 
374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  35.73 
 
 
378 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  36.67 
 
 
379 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  34.66 
 
 
367 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  37.18 
 
 
372 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  35.06 
 
 
372 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  37.32 
 
 
378 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  36.6 
 
 
371 aa  216  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  38.81 
 
 
372 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  38.81 
 
 
372 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  34.35 
 
 
373 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  36.87 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  35.14 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  36.42 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  37.57 
 
 
372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  38.51 
 
 
372 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  38.51 
 
 
372 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  33.61 
 
 
367 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  33.61 
 
 
367 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  33.61 
 
 
367 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  38.51 
 
 
372 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  33.61 
 
 
367 aa  212  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  33.61 
 
 
367 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  33.61 
 
 
367 aa  212  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  33.61 
 
 
367 aa  212  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  33.61 
 
 
367 aa  212  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  33.61 
 
 
367 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  32.4 
 
 
369 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  36.23 
 
 
387 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 
367 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  34.42 
 
 
366 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  36.28 
 
 
367 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  36.44 
 
 
372 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  35.67 
 
 
380 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  33.64 
 
 
370 aa  209  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  36.97 
 
 
380 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  36.97 
 
 
380 aa  209  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  37.15 
 
 
373 aa  209  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  35.49 
 
 
367 aa  209  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  34.75 
 
 
372 aa  208  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  36.84 
 
 
373 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  37.57 
 
 
372 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  35.8 
 
 
378 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  34.26 
 
 
372 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  34.91 
 
 
373 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  37.28 
 
 
372 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  33.52 
 
 
363 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  32.77 
 
 
367 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  32.77 
 
 
367 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  32.77 
 
 
367 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  32.77 
 
 
367 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  32.77 
 
 
367 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  37.91 
 
 
372 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  34.66 
 
 
367 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  34.26 
 
 
372 aa  206  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  35.23 
 
 
367 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>