51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0676 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  100 
 
 		 382 aa  777    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  76.3 
 
 		 384 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  78.39 
 
 		 383 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  74.87 
 
 		 381 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  68.05 
 
 		 387 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  69.35 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  68.93 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  68.67 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  59.13 
 
 		 381 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  31.4 
 
 		 356 aa  135  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  31.25 
 
 		 425 aa  126  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  32.84 
 
 		 368 aa  125  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  26.35 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  25.77 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  27.58 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  26.04 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  24.47 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  26.57 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  25.31 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0825  hypothetical protein  24.32 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  23.65 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  23.65 
 
 		 422 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  29.49 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  22.63 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  27.1 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  26.16 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  22.26 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  23.53 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  23.01 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  20.21 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  22.63 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  24.1 
 
 		 366 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  23.96 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  24.12 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  25.79 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  23.23 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  21.61 
 
 		 426 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  21.61 
 
 		 372 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  22.19 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  21.26 
 
 		 354 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  21.77 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  22.05 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  25.49 
 
 		 344 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  26.39 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  23.47 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  20.76 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  21 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  23.53 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  22.62 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  20.42 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  21.15 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>