45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2557 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  100 
 
 
431 aa  888    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  63.29 
 
 
425 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  61.85 
 
 
424 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  61.35 
 
 
424 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  59.71 
 
 
426 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  57.01 
 
 
417 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  58.85 
 
 
441 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  58.85 
 
 
422 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  57.79 
 
 
422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  54.48 
 
 
420 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  57.71 
 
 
422 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  58.33 
 
 
420 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  54.31 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  55.44 
 
 
441 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  56.14 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  50.12 
 
 
431 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  54.96 
 
 
445 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  56.3 
 
 
448 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  54.45 
 
 
443 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  54.45 
 
 
444 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  55.5 
 
 
452 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  50.71 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  50.95 
 
 
420 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  55.23 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  52.3 
 
 
446 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  53.94 
 
 
445 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  53.5 
 
 
417 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  51.79 
 
 
475 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  51.89 
 
 
435 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  45.62 
 
 
486 aa  261  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  39.17 
 
 
482 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  41.11 
 
 
480 aa  257  3e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  39.32 
 
 
429 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  38.69 
 
 
428 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  36.14 
 
 
441 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  36.97 
 
 
400 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  37.6 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  38.7 
 
 
407 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  35.97 
 
 
410 aa  211  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  25.48 
 
 
425 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  20.27 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  23.53 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  28.86 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  21.51 
 
 
383 aa  47  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  31.68 
 
 
384 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>