40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2203 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  688    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  52.08 
 
 		 338 aa  309  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  44.87 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  44.48 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  44.87 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  31.23 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  30.7 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  29.81 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  31.52 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  31.23 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  31.21 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  29.48 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  27.58 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  26.8 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  27.02 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  26.67 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  26.36 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  26.36 
 
 		 354 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  26.95 
 
 		 354 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  24.93 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  24.23 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  26.24 
 
 		 374 aa  86.3  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  28.1 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  26.69 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  27.79 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  25.08 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  24.7 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  25.65 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  25.3 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  24.53 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  26.99 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  30.38 
 
 		 425 aa  67  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  26.39 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  22.73 
 
 		 387 aa  53.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  23.2 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  23.95 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 384 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  23.11 
 
 		 381 aa  46.2  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  23 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0548586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>