46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  707    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  67.82 
 
 		 353 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  60.56 
 
 		 354 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  60.56 
 
 		 354 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  58.76 
 
 		 354 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  58.47 
 
 		 354 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  58.19 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  57.34 
 
 		 354 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  58.19 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  61.3 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  60.45 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  30.15 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  28.73 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  28.78 
 
 		 377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  30.72 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  30.77 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  29.9 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  29.43 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  26.58 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  25.84 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  26.83 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  26.67 
 
 		 358 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  26.99 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  26.22 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  29.97 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  25.36 
 
 		 391 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  25.91 
 
 		 389 aa  86.7  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  24.92 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  23.83 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  29.97 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  26.28 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  29.97 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  22.13 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  24.1 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  26.65 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  21.39 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  27.22 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  22.31 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  21.26 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1527  periplasmic lipoprotein-like protein  25.16 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  21.43 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  20.54 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  20.28 
 
 		 386 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  20.28 
 
 		 386 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  19.94 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  19.54 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>