34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0694 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  100 
 
 		 381 aa  773    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  62.2 
 
 		 381 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  61.84 
 
 		 387 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  60.99 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  62.63 
 
 		 383 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  58.27 
 
 		 382 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  60.16 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  59.64 
 
 		 386 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  59.38 
 
 		 386 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  25.58 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  26.29 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  27.54 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  27.58 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  23.89 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  23.92 
 
 		 441 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  25.39 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  24.07 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  22.87 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0825  hypothetical protein  24.75 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  22.56 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  22.33 
 
 		 354 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  21.24 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  20.63 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  24.32 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  21.7 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  27.52 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  23.03 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  23.18 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  20.54 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  19.68 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  20.31 
 
 		 353 aa  47  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  24.93 
 
 		 372 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  22.19 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  20.7 
 
 		 354 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>