40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0791 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  88.57 
 
 		 384 aa  691    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  100 
 
 		 381 aa  773    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  79.37 
 
 		 383 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  74.09 
 
 		 387 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  74.87 
 
 		 382 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  74.29 
 
 		 387 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  74.15 
 
 		 386 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  73.89 
 
 		 386 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  62.67 
 
 		 381 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  29.34 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  29.76 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  31.97 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  28.08 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  26.03 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  21.82 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0825  hypothetical protein  23.96 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  23.06 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  26.74 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  23.25 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  24.36 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  22.78 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  24.5 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  28.95 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  21.49 
 
 		 441 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  23.76 
 
 		 372 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  25.68 
 
 		 379 aa  53.1  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  21.49 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  23.46 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  21.21 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  28.86 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  20.48 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  22.47 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  20.91 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  23.11 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  25.93 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  23.04 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  20.16 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  19.94 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  24.28 
 
 		 366 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  20.96 
 
 		 353 aa  42.7  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>