49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  72.46 
 
 		 443 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  892    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  71.91 
 
 		 445 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  72.75 
 
 		 444 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  77.75 
 
 		 445 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  72.42 
 
 		 446 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  72.36 
 
 		 445 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  70.76 
 
 		 448 aa  625  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  71.52 
 
 		 475 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  70.8 
 
 		 452 aa  621  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  69.21 
 
 		 458 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  61.94 
 
 		 420 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  64.01 
 
 		 435 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  60.45 
 
 		 423 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  61.12 
 
 		 431 aa  504  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  62.18 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  56.03 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  56.03 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  53.23 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  56.27 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  55.44 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  53.23 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  50.72 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  49.76 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  50.77 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  50.13 
 
 		 424 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  53.46 
 
 		 420 aa  358  9e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  51.68 
 
 		 422 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  47.41 
 
 		 428 aa  342  5.999999999999999e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  41.09 
 
 		 486 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  40.52 
 
 		 482 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  40.04 
 
 		 480 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  42.73 
 
 		 441 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  43.54 
 
 		 428 aa  280  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  44.13 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  42.67 
 
 		 399 aa  259  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  42.02 
 
 		 400 aa  253  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  36.93 
 
 		 429 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  35.76 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  25.94 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  24.2 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  28.29 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  25.09 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  22.99 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  22.25 
 
 		 382 aa  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  23.62 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  24.35 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>