32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0668 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  767    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  31.93 
 
 		 384 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  28.28 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  27.2 
 
 		 377 aa  146  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  27.57 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  25.28 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  23.81 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  24.05 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  22.16 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  21.91 
 
 		 354 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  22.13 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  21.81 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  22.03 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  20.94 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  21.91 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  22.53 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  21.65 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  22.25 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  23.46 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  21.28 
 
 		 345 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  23.18 
 
 		 382 aa  53.1  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  21.04 
 
 		 387 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  21.26 
 
 		 354 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  21.31 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  20.63 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  20.21 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  20 
 
 		 354 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  19.72 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  19.75 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0805  periplasmic lipoprotein-like protein  21.18 
 
 		 355 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  28.23 
 
 		 345 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  21.43 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>