48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0722 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  100 
 
 		 387 aa  788    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  74.09 
 
 		 381 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  76.04 
 
 		 387 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  71.58 
 
 		 384 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  77.34 
 
 		 386 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  71.43 
 
 		 383 aa  552  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  76.82 
 
 		 386 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  68.05 
 
 		 382 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  61.79 
 
 		 381 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  28.86 
 
 		 356 aa  124  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  30.27 
 
 		 368 aa  123  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  30.38 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  27.01 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  25.78 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  23.24 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  23.22 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0825  hypothetical protein  24.24 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  24.92 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  24.79 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  24.39 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  22.46 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  22.46 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  23.93 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  23.63 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  22.16 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  27.01 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  22.16 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  22.47 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  28.12 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  23.02 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  22.16 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  21.43 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  22.71 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  22.11 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  38.75 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  24.22 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  22.31 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  21.99 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  22.41 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  22.63 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  23.12 
 
 		 424 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  22.43 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  23.57 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  21.39 
 
 		 435 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  22.18 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  22.36 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  23.02 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  21.43 
 
 		 377 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>