18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08516 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  765    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  40.06 
 
 
384 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  36.53 
 
 
377 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  30.03 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  25.28 
 
 
378 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  21.47 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  25.68 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  27.32 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  26.49 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  31.4 
 
 
383 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  26.38 
 
 
356 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  22.22 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  22.22 
 
 
435 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  28.16 
 
 
387 aa  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  20.98 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  30.17 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  23.62 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  22.38 
 
 
431 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>