18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0310 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  769    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  57.27 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  36.95 
 
 		 379 aa  239  8e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  30.03 
 
 		 372 aa  152  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  27.76 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  22.77 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  23.13 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  21.82 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  23.22 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  21.89 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  20.21 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  22.6 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  23.04 
 
 		 356 aa  47  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  22.29 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  19.57 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  19.83 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  20.17 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  28.8 
 
 		 380 aa  42.7  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>