46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4366 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  100 
 
 		 452 aa  914    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  70.58 
 
 		 441 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  78.98 
 
 		 445 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  79.87 
 
 		 445 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  75.5 
 
 		 475 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  79.65 
 
 		 444 aa  696    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  75.28 
 
 		 445 aa  671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  76.38 
 
 		 446 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  79.87 
 
 		 443 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  90.83 
 
 		 458 aa  791    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  82.3 
 
 		 448 aa  713    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  63.24 
 
 		 435 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  59.95 
 
 		 420 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  58.69 
 
 		 431 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  60.1 
 
 		 423 aa  488  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  60.66 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  54.12 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  54.41 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  50.92 
 
 		 441 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  52.57 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  52.66 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  52.06 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  54.26 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  53.23 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  53.12 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  51.16 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  52.58 
 
 		 422 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  52.65 
 
 		 420 aa  344  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  45.91 
 
 		 428 aa  326  6e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  39.88 
 
 		 486 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  39.2 
 
 		 482 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  44.94 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  39.58 
 
 		 480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  40.6 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  42.74 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  45.41 
 
 		 407 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  42.13 
 
 		 400 aa  251  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  38.39 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  38.95 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  24.92 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  25.07 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  22.84 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  23.97 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  22.29 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  23.58 
 
 		 356 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  23.83 
 
 		 384 aa  43.1  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>