43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003123 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  100 
 
 
420 aa  863    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  93.57 
 
 
423 aa  811    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  75 
 
 
435 aa  666    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  71.43 
 
 
417 aa  616  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  65.25 
 
 
445 aa  537  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  62.25 
 
 
431 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  62.78 
 
 
441 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  60.76 
 
 
446 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  60 
 
 
475 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  62.14 
 
 
458 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  60.61 
 
 
444 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  61.88 
 
 
452 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  60.1 
 
 
445 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  60.61 
 
 
443 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  61.89 
 
 
448 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  60.1 
 
 
445 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  53.09 
 
 
425 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  49.88 
 
 
422 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  49.64 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  50.95 
 
 
431 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  49.16 
 
 
420 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  51.37 
 
 
422 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  51.51 
 
 
422 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  53.21 
 
 
424 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  53.21 
 
 
424 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  50.39 
 
 
417 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  52.01 
 
 
426 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  49.27 
 
 
420 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  48.66 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  41.22 
 
 
482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  41.75 
 
 
480 aa  312  5.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  41.97 
 
 
486 aa  310  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  42.78 
 
 
428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  41.13 
 
 
441 aa  275  8e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  40.38 
 
 
400 aa  256  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  42.67 
 
 
407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  41.07 
 
 
429 aa  253  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  39.37 
 
 
399 aa  249  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  37.02 
 
 
410 aa  219  8.999999999999998e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  21.82 
 
 
356 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  22.87 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  21.75 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  26.47 
 
 
368 aa  47.8  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0548586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>