29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0345 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0345  imelysin  100 
 
 		 359 aa  738    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  23.21 
 
 		 452 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  24.32 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  26.15 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  22.87 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  24.77 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  22.78 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  23.77 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  24.37 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  23.71 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  26.96 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  25.46 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  24.54 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  20.81 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  23.29 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  22.83 
 
 		 443 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  23.18 
 
 		 446 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  22.58 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  22.83 
 
 		 475 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  23.91 
 
 		 424 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  23.5 
 
 		 417 aa  49.7  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  24.32 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  25.46 
 
 		 420 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  23.48 
 
 		 424 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  24 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  22.22 
 
 		 426 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  24.89 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  21.74 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  21.96 
 
 		 435 aa  43.5  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>