41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0688 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  100 
 
 		 429 aa  885    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  41.8 
 
 		 417 aa  262  8e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  38.93 
 
 		 431 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  41.07 
 
 		 420 aa  253  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  39.9 
 
 		 435 aa  249  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  39.2 
 
 		 423 aa  249  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  40.05 
 
 		 431 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  38.16 
 
 		 417 aa  243  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  40.6 
 
 		 425 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  40.38 
 
 		 486 aa  236  6e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  38.8 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  38.68 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  36.7 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  39.31 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  38.62 
 
 		 475 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  41.44 
 
 		 482 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  39.5 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  39.14 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  39.95 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  39.73 
 
 		 424 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  38.02 
 
 		 445 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  39.46 
 
 		 448 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  38.57 
 
 		 458 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  38.96 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  37.53 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  37.83 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  38.26 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  38.34 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  37.97 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  39.31 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  38.35 
 
 		 420 aa  212  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  37 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  39.04 
 
 		 420 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  33.08 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  35.92 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  36.31 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  36.97 
 
 		 407 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  36.6 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  33.98 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  26.96 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  25.93 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0548586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>