24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1330 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  100 
 
 		 372 aa  755    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  30.9 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  30.03 
 
 		 377 aa  152  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  29.71 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  29.77 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  22.34 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  21.32 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  26.29 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  24.28 
 
 		 353 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  23.76 
 
 		 381 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  22.28 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  26.89 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  22.43 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  21.61 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  21.24 
 
 		 425 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  23.58 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  24.93 
 
 		 381 aa  46.6  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  21.99 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  21.32 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  23.8 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  25.93 
 
 		 345 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>