61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3870 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  100 
 
 
391 aa  773    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  29.75 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  28.61 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  27.98 
 
 
387 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  28.77 
 
 
381 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  28.72 
 
 
378 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  28.05 
 
 
387 aa  112  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  27.12 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  25.61 
 
 
384 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  28.1 
 
 
381 aa  106  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  23.24 
 
 
372 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  23.56 
 
 
377 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  28.85 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  25.29 
 
 
353 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  25.07 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  28.61 
 
 
386 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  28.61 
 
 
386 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  25.86 
 
 
354 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  28.14 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  25.29 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  21.74 
 
 
379 aa  77  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  24.71 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  24.71 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  24.74 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  24.58 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  25.38 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  23.5 
 
 
354 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  25 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  24.14 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  24.81 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  23.86 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  24.86 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  23.45 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  24.87 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  24.16 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  23.34 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  22.74 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  25.69 
 
 
373 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  23.15 
 
 
335 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  21.07 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0805  periplasmic lipoprotein-like protein  25.58 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  23.05 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  24.16 
 
 
389 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  23.69 
 
 
368 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1923  periplasmic lipoprotein-like protein  26.63 
 
 
375 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.576984  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  23.02 
 
 
342 aa  53.5  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  24.87 
 
 
441 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  22.26 
 
 
374 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  23.41 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  24.56 
 
 
445 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1527  periplasmic lipoprotein-like protein  25.15 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  22.44 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  23.44 
 
 
441 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  26.29 
 
 
329 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  26.42 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  23.99 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1460  periplasmic lipolike protein  24.71 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0139053  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  21.51 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  31.37 
 
 
420 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  23.35 
 
 
431 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  21.67 
 
 
399 aa  43.1  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>