38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2559 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  100 
 
 
352 aa  732    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  27.6 
 
 
338 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  26.2 
 
 
358 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  27.75 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  24.1 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  28.02 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  26.88 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  23.62 
 
 
344 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  26.88 
 
 
354 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  26.73 
 
 
366 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  25.98 
 
 
354 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  26.58 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  26.61 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  26.35 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  26.42 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  26.44 
 
 
338 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  24.92 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  25.75 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  25.52 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  26.15 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  26.46 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  26.54 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  26.46 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  27.51 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  25 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  24.05 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  21.8 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  23.55 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  22.69 
 
 
389 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  25 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  24.84 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  22.29 
 
 
373 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  21.07 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0805  periplasmic lipoprotein-like protein  22.18 
 
 
355 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  21.74 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  20.42 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  24.46 
 
 
425 aa  43.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  21.11 
 
 
383 aa  42.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>