44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0333 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  764    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  49.46 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  50.6 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  44.8 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  33.61 
 
 		 358 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  27.61 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  26.69 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  27.89 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  25.37 
 
 		 354 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  25.37 
 
 		 354 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  27.81 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  27.68 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  25 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  24.1 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  24.32 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 354 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  24.92 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  28.26 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  29.76 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  25.3 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  28.57 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  23.83 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  30.06 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  27.35 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  23.82 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  23.36 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  24.19 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  25.44 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  21.74 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  22.81 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1923  periplasmic lipoprotein-like protein  25.82 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.576984  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  18.53 
 
 		 339 aa  53.1  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  23.84 
 
 		 384 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1527  periplasmic lipoprotein-like protein  24.29 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  28.86 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  22.34 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  25.35 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  33.57 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0805  periplasmic lipoprotein-like protein  23.37 
 
 		 355 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  23.47 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1460  periplasmic lipolike protein  25.85 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  21.32 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  34.29 
 
 		 426 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  34.52 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>